近期，國(guó)內(nèi)植物單細(xì)胞RNA測(cè)序相關(guān)研究再發(fā)力。2020年6月24日蛤吓，河南大學(xué)孫旭武教授課題組在Molecular Plant在線(xiàn)發(fā)表了題為Global Dynamic Mol...
IP屬地：湖北
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國(guó)內(nèi)植物單細(xì)胞RNA測(cè)序相關(guān)研究再發(fā)力
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CellRanger走起(四) Cell Ranger流程概覽劉小澤寫(xiě)于19.5.7主要看流程，這一篇不涉及真實(shí)數(shù)據(jù)展示 總的來(lái)說(shuō)缸血，Cell Ranger主要的流程有：拆分?jǐn)?shù)據(jù) mkfastq缓呛、細(xì)胞定量 count蛉迹、定量組合 aggr、...
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學(xué)習(xí)單細(xì)胞測(cè)序
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課程會(huì)在2019年9月底之前錄制完畢并上線(xiàn)： 課程說(shuō)明在：https://mp.weixin.qq.com/s/AV2uTbsvJGBRq_zv7yDmNg 所有代碼在：https://github.com/jmzeng1314/scRNA_smart_seq2 觀(guān)看鏈接 手機(jī)微信觀(guān)看（推薦）：http://jm.grazy.cn/wechat/course/detail?cid=53 電腦瀏覽器的鏈接 http://jm.grazy.cn/index/mulitcourse/detail.html?cid=53
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解析單細(xì)胞RNA-Seq Nature文章這是我聽(tīng)孟浩巍知乎Live：生信進(jìn)階第1課-重復(fù)Nature文章和B站視頻：高通量測(cè)序技術(shù)交流錄像里的筆記哦~ 目錄：文章的主要結(jié)論解讀傳統(tǒng)RNA-Seq建庫(kù)方法幾種主要的單...
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周運(yùn)來(lái)空闲，男，長(zhǎng)大了才會(huì)遇到的帥哥走敌，穩(wěn)健碴倾，瀟灑，大方掉丽，靠譜跌榔。一段生信緣，一棵技能樹(shù)捶障。生信技能樹(shù)核心成員僧须，單細(xì)胞天地供稿人，簡(jiǎn)書(shū)創(chuàng)作者项炼，單細(xì)胞數(shù)據(jù)科學(xué)家担平。
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【r<-基礎(chǔ)|統(tǒng)計(jì)】頻數(shù)檢驗(yàn)
問(wèn)題 你有分類(lèi)數(shù)據(jù)然后想要檢驗(yàn)是否這些數(shù)據(jù)值的頻數(shù)分布是否與預(yù)期不符柑蛇，或者是否組間的頻數(shù)分布有（顯著）差異。 方案 頻數(shù)檢驗(yàn)通常解決兩類(lèi)問(wèn)題： 頻數(shù)分布與預(yù)期或者理論的分布（...
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當(dāng)你用setwd的時(shí)候驱闷，能考慮一下Rproject的感受嗎
我在線(xiàn)下課程中講過(guò)耻台，R語(yǔ)言文件讀取只有一個(gè)報(bào)錯(cuò)，就是： 傳統(tǒng)的R語(yǔ)言書(shū)和課程里會(huì)講空另，setwd（）這個(gè)命令是設(shè)置工作目錄用的盆耽，所謂工作目錄就是圖片導(dǎo)出、腳本保存扼菠、數(shù)據(jù)讀取的默...
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中科院遺傳發(fā)育所博士研究生，科研搬磚工一枚秧饮，專(zhuān)業(yè)植物遺傳學(xué)映挂，生信菜鳥(niǎo)，立志成為一名做得了實(shí)驗(yàn)盗尸，玩兒得轉(zhuǎn)生信的科研老鳥(niǎo)～
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基因型填充之后如何過(guò)濾比如 個(gè)體分型率 < 90% 某一個(gè)樣本測(cè)出來(lái)的標(biāo)記小于全部標(biāo)記的90% 標(biāo)記分型率 < 90% 某一個(gè)標(biāo)記只在小于90%的樣本中存在 最小等位基因頻率 < 0.05 這個(gè)一...
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樓主您好柑船，想請(qǐng)教您一下，minQ是如何計(jì)算的泼各，對(duì)應(yīng)vcf文件的哪一個(gè)值鞍时？，我查看了vcf文件的每一項(xiàng)扣蜻，感覺(jué)沒(méi)有能對(duì)應(yīng)上的逆巍，是否經(jīng)過(guò)轉(zhuǎn)換
關(guān)于SNP的過(guò)濾（1）：如何使用vcftools進(jìn)行SNP過(guò)濾
前言 很多關(guān)注我這個(gè)專(zhuān)題的朋友都在后臺(tái)留言，說(shuō)想了解更多關(guān)于SNP過(guò)濾的東西莽使。是的锐极，確實(shí)這是一個(gè)比較重要的問(wèn)題。第一吮旅，過(guò)濾到一些低質(zhì)量的SNP可以防止calling一些假陽(yáng)性...
