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  • SNPs calling流程(GATK4)

    SNPs marker是全基因組范圍應(yīng)用廣泛的分子標(biāo)記擦盾,本文介紹生態(tài)基因組學(xué)中利用GATK4軟件進(jìn)行SNPs calling的流程(人的研究中可能略有不同)嘲驾。以下所有分析過(guò)程...

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    除了GO基因本體論,還有PO迹卢、TO辽故、CO等各種Ontology?

    我們最常用最熟悉的功能數(shù)據(jù)庫(kù)之一:GO(gene onotology)腐碱,基因本體論誊垢。其實(shí)是一套標(biāo)準(zhǔn)詞匯術(shù)語(yǔ),目的是從不同角度來(lái)描述某個(gè)基因的特點(diǎn)和功能症见,三大本體如生物學(xué)進(jìn)程(...

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    eQTL就那樣~(1)

    前言 我還未想到這個(gè)專題叫什么...... 暫定“XXX就那樣”喂走? 我們先來(lái)個(gè)斗雞眼,看著一下中間的QT谋作。 1.什么是數(shù)量性狀芋肠?(quantitative trait,QT)...

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    ref1:deeptools輔助CHIP-seq數(shù)據(jù)分析-可視化 | 生信菜鳥(niǎo)團(tuán) ref2:如何使用deeptools處理BAM數(shù)據(jù) - 生信技能樹(shù) ref3:The too...

  • 你好遵蚜,請(qǐng)問(wèn)你現(xiàn)在可視化的應(yīng)該是reads在基因結(jié)構(gòu)的分布情況吧帖池,那怎么可視化call peak后的peaks在基因結(jié)構(gòu)上的分布呢

    陀螺 評(píng)論自deeptools可視化
  • 個(gè)人網(wǎng)站建設(shè)日記第1篇2022-08-03

    今天我的個(gè)人網(wǎng)站提交的備案已經(jīng)通過(guò)服務(wù)商提交管局審核了奈惑,靜待7-20個(gè)工作日內(nèi)早點(diǎn)通過(guò)審核獲得備案號(hào)。 接觸網(wǎng)絡(luò)已有21年了睡汹,21年前的一個(gè)晚上肴甸,和師范同學(xué)帶著獵奇的心理跑到...

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    單倍型分析

    一、什么是單倍型帮孔? 在單倍型分析前雷滋,首先需要明白什么是單倍型、什么是基因單倍型文兢? 一般來(lái)講晤斩,所謂的單倍型是指同一染色體上不同變異位點(diǎn)的各種線性組合形式。那么基因單倍型自然就是...

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    GWAS分析-說(shuō)人話(20)-單倍體關(guān)聯(lián)分析

    前言 來(lái)到這里姆坚,已經(jīng)漸漸不是人話了... 估計(jì)這輩子我也沒(méi)有想到澳泵,我把我最厭惡的東西寫出來(lái), 居然是最多人看的...... 分析方法很多兼呵,這一小節(jié)吐槽官網(wǎng)的這一行代碼兔辅,大神請(qǐng)...

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    R使用筆記:相關(guān)系數(shù):cor.test();corr.test();rcorr()

    本次筆記內(nèi)容:cor.test()和cor()rcorr() {Hmisc}corr.test() {psych}spearmanCI() {spearmanCI} spea...

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