隨著技術(shù)的發(fā)展，動植物的全基因組測序到現(xiàn)在已經(jīng)超過了2000個屏富，而且這個驚人的數(shù)字是在最近三年內(nèi)得到爆發(fā)的。這樣體量的數(shù)據(jù)涌現(xiàn)莫矗，為分子生物學的發(fā)展提供了巨大的助力视译。最近三天身...
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2021-09-21基因的“命運” -
備忘！<br>備忘始赎！<br>備忘和橙！
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分析 | GO 富集分析
從研一來到組里，一直聽到 GO 富集分析幾個字极阅。直到現(xiàn)在胃碾，研二基本結(jié)束了，我都沒做過筋搏，也不會做仆百。有一個大概的認識，就是奔脐，自己的基因集中某種功能基因的占比要高于這種功能的基因在...
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學習筆記<br>研究方向: 植物群體遺傳學<br>
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周運來，男排龄，長大了才會遇到的帥哥波势，穩(wěn)健，瀟灑橄维，大方尺铣，靠譜。一段生信緣争舞，一棵技能樹凛忿。生信技能樹核心成員，單細胞天地供稿人竞川，簡書創(chuàng)作者店溢，單細胞數(shù)據(jù)科學家。
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RDA分析原理1. RDA的基本方法描述 冗余分析（RDA）和基于轉(zhuǎn)化的冗余分析（tb-RDA） Rao（1964）首次提出冗余分析（Redundancy analysis委乌，RDA）床牧，從概...
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2021-10-23基因組學與植物育種實際上，最近幾年我已經(jīng)參與了若干物種的基因組學項目遭贸。我一直在思考：除了提供一批數(shù)據(jù)之外叠赦，我們的研究還能對實際生產(chǎn)產(chǎn)生怎樣的推動作用？基因組組裝和基因注釋在整個育種研究中處于什...
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2021-11-12R包安裝報錯怎么解決實話說，這是一個非常龐大的問題除秀，因為這個牽扯到服務器硬件，系統(tǒng)等軟件因素算利，還有一些網(wǎng)絡問題導致的玄學問題册踩，復雜性導致它很有挑戰(zhàn)。但是效拭，我們不能因為有挑戰(zhàn)性就放棄了暂吉，畢竟總會不...
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2021-09-21基因的“命運”
隨著技術(shù)的發(fā)展，動植物的全基因組測序到現(xiàn)在已經(jīng)超過了2000個缎患，而且這個驚人的數(shù)字是在最近三年內(nèi)得到爆發(fā)的慕的。這樣體量的數(shù)據(jù)涌現(xiàn)，為分子生物學的發(fā)展提供了巨大的助力挤渔。最近三天身...
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2021-10-18不重裝升級windows下的R
1.更新R 打開現(xiàn)有版本的R肮街， 這時會提醒很多，要不要安裝最新版判导，安裝路徑嫉父，裝完了要不要把舊的R包拷貝過來等等，一路yes此時就安裝成功了眼刃，關閉兩個版本的R 2.Rstudi...
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2021-01-05ComplexHeatmap熱圖R包參數(shù)解讀
之前畫熱圖一直在用pheatmap,簡單美觀擂红，但是后面有了些特殊需求之后,人就不知足了仪际，所以轉(zhuǎn)到了功能更全面但是相對更難入手的 ComplexHeatmap[http://w...
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2020-11-22R腳本模板
此模板以shell語言下經(jīng)常用到的長數(shù)據(jù)變寬數(shù)據(jù)為例輸入數(shù)據(jù) aaa，第一列必須為計數(shù)昵骤，二三列不特殊要求树碱，不含列命 run: 得到兩個文件,以bbb為前綴
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2021-03-21R語言中的管道符 %>%
作為R語言基礎之一的 %>% 應用非常廣泛，但是我卻一直沒有系統(tǒng)地學習涉茧，實在不應該赴恨，今天研究記述一下。 什么是%>% %>% 作為一種管道符伴栓，意思是 %>% 把左邊的輸出傳遞...
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2021-03-02上古軟件silix的安裝因為項目需要伦连，安裝一個非常古老的軟件 silix，想要安裝的版本1.2.9已經(jīng)是14年的產(chǎn)物了钳垮。網(wǎng)址：http://lbbe.univ-lyon1.fr/-SiLiX-?la...
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精彩的文章都是一樣的饺窿，平庸的文章各有各的平庸
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文獻解讀（一）：植物基因組文獻前言 小編要分享的這篇文章是2020年10月19發(fā)表在Nature Communications雜志上歧焦，很榮幸征得作者本人（北京林業(yè)大學林木分子設計高精尖創(chuàng)新中心博士生 ...
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