寫(xiě)在前面的話(huà) 你既然點(diǎn)進(jìn)來(lái)了脑沿，說(shuō)明你多半用過(guò)這個(gè)軟件。但我猜非凌，大多數(shù)人早期使用這個(gè)軟件的時(shí)候狱庇，一定是趕鴨子上架：因?yàn)橐?huà)圖，所以必須會(huì)。 但你真的懂了么？ 太長(zhǎng)不看系列 對(duì)于...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：陜西
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你考慮過(guò)computeMatrix的工作原理么? -
R數(shù)據(jù)可視化12:曼哈頓圖曼哈頓圖的名字來(lái)源是因?yàn)槠湫稳缏D的天際線(xiàn)：高聳在較低高度的“建筑物”上方的摩天大樓的輪廓苛聘。主要用于GWAS結(jié)果的展示，今天讓我們來(lái)看看如何繪制曼哈頓圖忠聚。 什么是曼哈頓圖 ...
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生信筆記5-GWAS與eQTL引言 GWAS與eQTL都是用于研究基因位點(diǎn)與表型之間關(guān)系的手段焰盗，彼此之間存在很多的區(qū)別與聯(lián)系。 GWAS 全基因組關(guān)聯(lián)分析（Genome Wide Association ...
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空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù)匯總作者咒林，Evil Genius 分享一個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)，CROST, CROST應(yīng)用標(biāo)準(zhǔn)化處理流程整合了182個(gè)高質(zhì)量的空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)集爷光，涵蓋8個(gè)不同物種垫竞、35種組織類(lèi)型和56種疾病的...
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免疫學(xué)筆記-1 | T細(xì)胞分化發(fā)育及其Marker1 關(guān)鍵細(xì)胞類(lèi)型或Marker縮寫(xiě)： 骨髓多能造血干細(xì)胞 HSC 淋巴樣祖細(xì)胞 lymphoid progenitor cell T細(xì)胞抗原識(shí)別受體 TCR 抗原提呈細(xì)胞 A...
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單細(xì)胞PBMC經(jīng)典細(xì)胞類(lèi)型marker背marker list 不要貪多哦，要慢慢地背蛀序，一個(gè)一個(gè)一個(gè)地背欢瞪，然后背了再很快地忘記，如此反復(fù)徐裸。 外周血單個(gè)核細(xì)胞（Peripheral blood mononucle...
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Seurat取子集時(shí)會(huì)用到的函數(shù)和方法在單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析中遣鼓，在確定細(xì)胞類(lèi)型后，除了可以進(jìn)行差異表達(dá)基因分析外重贺，還可以針對(duì)單個(gè)細(xì)胞類(lèi)型進(jìn)行分析特定分析骑祟，這時(shí)就需要我們提取細(xì)胞子集分開(kāi)處理了。 一气笙、Seurat數(shù)據(jù)格式...
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組/AverageExpression平均表達(dá)是個(gè)啥
AverageExpression gzh：BBio Seurat中用于計(jì)算cluster基因平均表達(dá)值的函數(shù)次企，為啥這個(gè)結(jié)果和FindMarkers中差異倍數(shù)avg_logF...
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文獻(xiàn)閱讀-《Tutorial: guidelines for the computational analysis of single-cell RNA sequencing data》文獻(xiàn)名稱(chēng)：教程：?jiǎn)渭?xì)胞 RNA 測(cè)序數(shù)據(jù)的計(jì)算分析指南文獻(xiàn)期刊：nature protocols發(fā)表時(shí)間：2021-1-9 摘要 單細(xì)胞 RNA 測(cè)序技術(shù) (scRNA-se...
