SRA數(shù)據(jù)庫是用于存儲(chǔ)二代測序的原始數(shù)據(jù)筒愚，包括 454厅贪，Illumina孝情，SOLiD竖螃，IonTorrent记舆，Helicos 和 Complete Genomics拨扶。除了原始序...
發(fā)簡信
IP屬地：北京
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下載二代測序益楼，單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)SRA筐钟，fastq文件等 -
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高尿酸就等于痛風(fēng)？你的關(guān)于高尿酸的七個(gè)誤解
尿酸(uricacid)是嘌呤代謝的終末產(chǎn)物他宛，嘌呤代謝紊亂船侧、能量代謝異常及腎臟對尿酸的排泄障礙均可引起血漿尿酸濃度升高(高尿酸血癥)或降低(低尿酸血癥)。 尿酸1/3是由食物...
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InterProScan 最強(qiáng)基因功能注釋軟件 - 最簡流程代碼參考官方文檔堕汞，目前 Interproscan 本地版幾乎免安裝勺爱，自帶數(shù)據(jù)庫，使用簡單讯检。 下載與安裝 跳轉(zhuǎn)到軟件放置目錄 注意到軟件依賴 Java11 或者以上 使用軟件 蛋白...
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SRA Toolkit - prefetch 快速下載NCBI SRA數(shù)據(jù)sratoolkit 是NCBI提供的用于處理來自SRA 數(shù)據(jù)庫測序數(shù)據(jù)的一個(gè)工具包琐鲁。 #1. sratoolkit 配置 #1.1 sratoolkit 下載 首先卫旱，下載最...
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Hisat2+FeatureCounts+DESeq2流程+作圖！featureCounts是一個(gè)用來統(tǒng)計(jì)count數(shù)的軟件围段，運(yùn)行的速度飛快顾翼，比之前用的htseq-count快了好多好多。 照例先說一下怎么下載這個(gè)軟件： 然后來說這次的流程...
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努力努力再努力~<br>個(gè)人博客：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Flishensuo.github.io%2F" target="_blank">https://lishensuo.github.io/</a>
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有測試版鏈接嗎？
IGV-GSAman | 極大提高「功能基因組學(xué)」研究效率的基因組瀏覽器
寫在前面 今天周末冯遂，轉(zhuǎn)眼10月份只剩一周蕊肥。萬萬沒想到，一個(gè)月下去蛤肌，我還是花了不少時(shí)間在完善「GSAman」壁却。至于為什么本來「兩個(gè)小時(shí)」就干完的事情，可以干成「22天」裸准？到底還...
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微生物群落的安娜·卡列尼娜原則AKP預(yù)測微生物對擾動(dòng)的反應(yīng)是微生物學(xué)的一個(gè)基本挑戰(zhàn)炒俱。大多數(shù)關(guān)于微生物組動(dòng)力學(xué)的研究都集中于研究微擾使動(dòng)物微生物群從健康狀態(tài)轉(zhuǎn)變?yōu)榉墙】捣€(wěn)定狀態(tài)的模式盐肃。 本文提出了另一種設(shè)想，即許...
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NGS分析手把手教學(xué)：零基礎(chǔ)RNA-seq轉(zhuǎn)錄組分析實(shí)踐向胡，兩套方案(2023年最新）??不想充值付費(fèi)的小伙伴可以點(diǎn)贊恼蓬，會(huì)隨機(jī)挑選幸運(yùn)觀眾贈(zèng)送全文。 NGS分析手把手教學(xué)系列繼WGS全基因組分析[http://www.reibang.com/p/04cacc...
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基因組結(jié)構(gòu)注釋軟件列表
基因組結(jié)構(gòu)注釋主要包括三個(gè)方面：從頭注釋（de novo prediction）僵芹、同源注釋（homology-based prediction）以及基于轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)注釋（tra...
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每組是三個(gè)樣品吧？
day53 三組轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析
學(xué)習(xí)及參考教程：https://mp.weixin.qq.com/s/uLt-bYCdVcBH6mqoIG_r6w[https://mp.weixin.qq.com/s/uL...
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ClusterProfiler基因集富集分析小槐，支持基因集物種為什么pathway富集分析結(jié)果沒有我感興趣的通路拇派？ 圖1 GSEA原理（圖片來自plob.org） GSEA分析原理 利用所有基因的表達(dá)值，計(jì)算每個(gè)基因在兩個(gè)表型（Clas...
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非靶向 | 靶向代謝組學(xué)數(shù)據(jù)分析總結(jié)-綱要@(Dayueban)[靶向|非靶向|代謝組學(xué)數(shù)據(jù)分析] 導(dǎo)讀 如今組學(xué)數(shù)據(jù)的產(chǎn)出量日益龐大凿跳。代謝組學(xué)數(shù)據(jù)也是如此件豌，隨著科技的創(chuàng)新和技術(shù)的變革，允許科研工作者們通過大樣本數(shù)據(jù)...
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跟著Nature Communications學(xué)作圖：R語言ggtree繪制進(jìn)化樹論文 A highly conserved core bacterial microbiota with nitrogen-fixation capacity inhabit...
