抱歉拖了這么久绅这，主要是最后分析出來(lái)的數(shù)據(jù)跟某平臺(tái)對(duì)比后發(fā)現(xiàn)差了很多柑司。無(wú)法解釋這個(gè)結(jié)果。用了幾個(gè)軟件測(cè)試宏侍，最后的結(jié)果都跟之前平臺(tái)的Exp結(jié)果對(duì)不上。最后猜測(cè)可能還是這套數(shù)據(jù)有問(wèn)...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：陜西
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RNA-seq從入門(mén)到自閉（Trimmomatic和Fastp） -
【RNA-seq自學(xué)5】樣品分析之去接頭Trimmomatic以上兩張圖是fastqc的結(jié)果骨杂，都表明樣本序列中是含有接頭序列的天通，adapter content的結(jié)果為fail。必須去接頭才能進(jìn)行下一部的序列比對(duì)逼争、表達(dá)定量等等优床。Trimm...
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群體進(jìn)化分析--基因流及群體歷史分析——我愿稱之為史上最全基因流（也稱基因遷移）是指從一個(gè)物種的一個(gè)種群向另一個(gè)種群引入新的遺傳物質(zhì)，從而改變?nèi)后w“基因庫(kù)”的組成誓焦。通過(guò)基因交流向群體中引入新的等位基因胆敞，是遺傳變異一個(gè)非常重要的來(lái)源，...
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蕪湖，我又回來(lái)了赫粥，和坐過(guò)山車一樣
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PhyloPhlAn3系統(tǒng)進(jìn)化分析PhyloPhlAn3.0：https://huttenhower.sph.harvard.edu/phylophlan[https://huttenhower.sph.ha...
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宏基因組學(xué)/群體遺傳學(xué) 方向
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大佬喧笔，請(qǐng)問(wèn)這個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)怎么下啊帽驯，我./bin/checkm2 database --download總是報(bào)錯(cuò)
CheckM2終于更新了
文章標(biāo)題：CheckM2: a rapid, scalable and accurate tool for assessing microbial genome qualit...
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太牛了！
??【Perl】如何安裝Bioperl模塊书闸？
生信軟件繞不過(guò)Perl尼变，Perl繞不過(guò)Bioperl。而B(niǎo)ioperl的安裝總讓人頭大，尤其是對(duì)普通用戶嫌术。以下錯(cuò)誤你肯定經(jīng)常遇到： 這里記錄嘗試的過(guò)程哀澈，雖然前面幾個(gè)失敗了。但...
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【Perl】如何安裝Bioperl模塊度气？
生信軟件繞不過(guò)Perl割按，Perl繞不過(guò)Bioperl。而B(niǎo)ioperl的安裝總讓人頭大磷籍，尤其是對(duì)普通用戶适荣。以下錯(cuò)誤你肯定經(jīng)常遇到： 這里記錄嘗試的過(guò)程，雖然前面幾個(gè)失敗了院领。但...
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Pysam BAM操作SAM/BAM/CRAM files class pysam.AlignmentFile filepath_or_object 既可以是 文件路徑弛矛，也可以是文件對(duì)象； 如果輸...
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進(jìn)化樹(shù)-itol上色美化
進(jìn)化樹(shù)或者系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)在微生物及群體結(jié)構(gòu)分析中是很常見(jiàn)的分析條目。進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建有很多方法，結(jié)果也大體相似赋元，但是最終呈現(xiàn)的形式確是多種多樣的溅呢，今天給大家介紹使用itol進(jìn)行進(jìn)化樹(shù)的...
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SAM/BAM的CIGAR難點(diǎn)劉小澤寫(xiě)于2020.4.6記錄一個(gè)小知識(shí)點(diǎn)，比對(duì)后SAM/BAM的CIGAR這一列中的含義，重點(diǎn)是soft clipping 和 hard clipping的理解 首先了解S...
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請(qǐng)問(wèn)megahit如何基因組共組裝？
宏基因組分箱（五）Metawrap計(jì)算Bin豐度
導(dǎo)讀 用Metabat2分箱的方法見(jiàn)：宏基因組分箱（二）Metabat2分箱實(shí)戰(zhàn)[http://www.reibang.com/p/72a60906d9a7]。本篇將展示用...
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宏基因組分箱（五）Metawrap計(jì)算Bin豐度導(dǎo)讀 用Metabat2分箱的方法見(jiàn)：宏基因組分箱（二）Metabat2分箱實(shí)戰(zhàn)[http://www.reibang.com/p/72a60906d9a7]该编。本篇將展示用...
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Python數(shù)據(jù)可視化（十）：熱圖繪制使用seaborn包繪制熱圖 abcde00.2854420.9515430.6858120.9246320.30981210.3580510.6865730.2866150...
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爬蟲(chóng)之最新版微博評(píng)論爬取方法（非url中拼接page=num方法）前段時(shí)間在整理爬蟲(chóng)知識(shí)體系的時(shí)候课竣，本著實(shí)踐出真理的出發(fā)點(diǎn)，特意小試牛刀置媳，寫(xiě)了幾個(gè)不同類型的爬蟲(chóng)于樟。然而在寫(xiě)微博評(píng)論的爬蟲(chóng)的時(shí)候，意外的發(fā)現(xiàn)拇囊，微博評(píng)論的API竟然變了迂曲！據(jù)本姑娘記...
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