在Excel使用表格時班巩，經(jīng)常遇見一些很長的表格，在瀏覽表格中間段時，會需要一直來回滑動鼠標到首行或尾行去查看一些信息车吹，這樣非常不方便，那么Excel如何同時凍結(jié)首行和尾行呢？...
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Excel如何同時凍結(jié)首行和尾行托启？ -
太好用了歧强！批量生存分析，一步到位为肮，還支持最佳截點~花花寫于2020-7-15摊册。今天一口氣寫了幾個新的處理tcga數(shù)據(jù)的函數(shù)。加在tinyarray里了颊艳，1.3.1版本以上可用~當前版本有一個小缺點茅特，因為有一步用到了字符型和數(shù)...
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如何復現(xiàn)別人的四象限圖要復現(xiàn)的原圖來自文章：https://www.sohu.com/a/242022054_278730[https://www.sohu.com/a/242022054_278...
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理解SAM文件格式以及過濾sam文件RNA-seq或者ChIP-seq等等測序的上游分析流程里的比對步驟相信大家都知道假颇，我之前也只是按照各種教程去走流程，并沒有仔細的研究過每一步的內(nèi)容符相。今天這篇文章學習一下sa...
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Samtools使用大全
一拆融、簡介 Samtools是一個用于操作sam和bam格式文件的應用程序集合蠢琳，具有眾多的功能。 它從SAM（序列比對/映射）格式導入和導出镜豹，進行排序傲须，合并和索引，并允許快速檢...
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2021-04-22 bam文件中提取比對（mapped）或未比對上（unmapped）reads
flags 1 0x1 這序列是PE雙端測序 2 0x2 這序列和參考序列完全匹配趟脂，沒有錯配和缺失 4 0x4 這序列沒有mapping到參考序列上 8 0x8 這序列的ma...
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轉(zhuǎn)錄組分析 | 使用STAR進行比對
歡迎關注微信公眾號“生信小王子”泰讽！ 前幾期，小編已經(jīng)教大家完成了RNA-seq數(shù)據(jù)的質(zhì)控昔期，下面就要正式開始轉(zhuǎn)錄組分析啦已卸！ 通過二代測序我們可以獲得150bp左右的reads，...
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reads計數(shù)原理及featureCounts統(tǒng)計counts后的cpm和tpm計算摘錄：生信技能樹論壇 Kai statquest 要求：實現(xiàn)這個功能的軟件也很多硼一，還是煩請大家先自己搜索幾個教程累澡，入門請統(tǒng)一用htseq-count，對每個樣本都會輸出一個表...
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StatQuest學習筆記24——RPKM FPKM TPM
前言——主要內(nèi)容 這篇筆記是StatQuest系列筆記的第63節(jié)般贼，這篇筆記跳過59節(jié)愧哟，60節(jié)，61節(jié)主要是因為第63節(jié)的內(nèi)容是講RPKM哼蛆，F(xiàn)PKM和TPM這幾個概念的區(qū)別蕊梧，在...
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幾種標準化方法的學習筆記不管在RNA-seq還是ChIP-seq分析中，都涉及到一個概念腮介，就是標準化肥矢。作為一個剛?cè)腴T的小白，總是聽王院長和其他熟悉生信分析的同學們強調(diào)標準化的重要性叠洗。 為什么說它重要...
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featureCounts 得到的counts計算 cpm甘改、 tpm、FPKM
一灭抑、從上游輸出文件結(jié)果中獲取基因有效長度 一般而言楼誓，RNA-seq得到原始counts表達矩陣最常用到的上游軟件就是featureCounts和Salmon了，在這兩類軟件的...
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StatQuest——生物信息相關原理的入門系列(一)想學生信原理但是數(shù)學不好名挥？不想看一串串公式也想明白各種分析的原理疟羹？StatQuest會是一個非常不錯的選擇！ StatQuest: 該系列視頻是北卡羅來納大學教堂山分校制作的...
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為什么我不建議初學者使用ggpubr繪圖今天來談一下我對ggpubr包的看法禀倔，記得剛開始學習數(shù)據(jù)可視化分析時榄融，某一天突然看到ggpubr包感覺如獲至寶；被其文案所打動救湖，制作美觀可用于發(fā)表的圖表愧杯。Alboukadel...
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R語言學習指南(3) tidyverse的基礎使用tidyverse[https://www.tidyverse.org/packages]是為數(shù)據(jù)科學設計的R軟件包，它包含(ggplot2[https://ggplot2....
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