作者英上，Evil Genius 單細(xì)胞空間外顯子課程這周第四課就結(jié)束了，感興趣的可以聯(lián)系瓣窄。 今日參考文獻(xiàn) 從多樣本空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)(ST)數(shù)據(jù)中檢測和解剖異常組織結(jié)構(gòu)域(DDATD...
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多樣本空間轉(zhuǎn)錄組分析異常組織結(jié)構(gòu)域 -
單細(xì)胞空間多組學(xué)分析中的外顯子分析部分作者碉克，Evil Genius 之前分享了很多關(guān)于多組學(xué)的內(nèi)容了，其中涉及到外顯子的部分分析呢，我基本都一筆帶過了羊赵，很多高分文章都運(yùn)用到了外顯子突變類的信息分析，以下為文章示例...
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全外顯子組測序（WES）分析2: SigProfiler（突變特征分析）SigProfiler 提供一套全面、集成的生物信息學(xué)工具昧捷，用于執(zhí)行突變特征分析闲昭。該軟件涵蓋了從生成突變矩陣到特征提取的整個(gè)分析生命周期，以及繪圖和模擬支持功能靡挥。 1. Si...
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10X單細(xì)胞序矩、空間、WES測序分析揭示腫瘤微環(huán)境進(jìn)化區(qū)域異質(zhì)性作者跋破，Evil Genius 科研和臨床其實(shí)有很多共同的地方簸淀，大家都知道多組學(xué)是方向，目前單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組毒返、ATAC租幕、VDJ、空間轉(zhuǎn)錄組拧簸、空轉(zhuǎn)VDJ劲绪、宏基因組、外顯子等幾個(gè)方向...
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為小鼠(GRCm38) 構(gòu)建 GATK resource bundle前提：眾所周知盆赤，GATK 為人提供了 一些 boundle resource 珠叔，但是沒有提供小鼠的資源。比如dbsnp弟劲， indel祷安，這些都是需要自己準(zhǔn)備的。而在跑BaseR...
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課前準(zhǔn)備----空間轉(zhuǎn)錄組微生物檢測與分析作者兔乞，Evil Genius 參考文章Effect of the intratumoral microbiota onspatial and cellular heterog...
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GTF處理腳本 - GTFtoolsGTFtools：一個(gè)靈活而強(qiáng)大的GTF文件處理工具 GTFtools是一款用Python編寫的命令行工具汇鞭，專門用于處理基因轉(zhuǎn)錄格式（GTF）文件。GTF文件是一種用于描述基...
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單細(xì)胞筆記9-scATAC-seq測序方法和數(shù)據(jù)分析
引言 轉(zhuǎn)坐酶（Transpose）檢測染色質(zhì)開放性（Accessibility）結(jié)合高通量測序（Assay for Transposase-Accessible Chroma...
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什么是大型語言模型 庸追？引言 在本文[https://medium.com/@waylandzhang/what-is-large-language-model-llms-zero-to-hero-...
