隨著轉(zhuǎn)錄組技術(shù)的發(fā)展邑茄,空間轉(zhuǎn)錄組已經(jīng)正式走向商業(yè)化時(shí)代,作為單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析的工具箱的Seurat與時(shí)俱進(jìn),也相應(yīng)地開發(fā)了空間轉(zhuǎn)錄組分析的一套函數(shù)唉堪,讓我們跟隨卑微小王看看Seu...
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一、什么是批次效應(yīng) 批次效應(yīng)(batch effect),表示樣品在不同批次中處理和測(cè)量產(chǎn)生的與試驗(yàn)期間記錄的任何生物變異無關(guān)的技術(shù)差異。批次效應(yīng)是高通量試驗(yàn)中常見的變異來源...
火山圖是測(cè)序分析報(bào)告中最為核心的圖片之一僵驰。繪制火山圖的方法有許多,Excel和第三方軟件等唁毒,本文主要運(yùn)用ggplot2和ggrepel兩個(gè)R包演示[1][2]蒜茴。橫坐標(biāo)為Fol...
8種特殊建庫測(cè)序 8種特殊建庫測(cè)序 1. RNA-seq 2. 外顯子測(cè)序 3. small RNA-seq 4. 單細(xì)胞DNA測(cè)序 5. 單細(xì)胞mRNA測(cè)序 6. 甲基化測(cè)...
該文章是對(duì) https://www.youtube.com/watch?v=VvS8NEJGxnM 這個(gè)視頻進(jìn)行的總結(jié)梳理。 特此感謝陳巍老師浆西,更多關(guān)于基因的內(nèi)容請(qǐng)關(guān)注微信公...
劉小澤寫于18.11.25每學(xué)習(xí)一遍之前的知識(shí)粉私,總能從不同角度獲取一些觀點(diǎn),然后擴(kuò)增自己的知識(shí)庫近零,這就是“知識(shí)迭代”這次我也就是想到哪寫到哪诺核,把自己認(rèn)為重要的內(nèi)容梳理下,用Q...
摘要:從1977年第一代DNA測(cè)序技術(shù)(Sanger法)[1] 發(fā)展至今三十多年時(shí)間久信,測(cè)序技術(shù)已取得了相當(dāng)大的發(fā)展猪瞬,從第一代到第三代乃至第四代,測(cè)序讀長(zhǎng)從長(zhǎng)到短入篮,再從短到長(zhǎng)。...