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開干 #運行包 library(ggplot2) library(readxl) library(dplyr) #讀表萄金，%>%是dplyr包里面的 data <- read_...

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文章來源：中國科學院大學生態(tài)環(huán)境中心土壤生態(tài)過程與生態(tài)重建研究組陳保冬研究團隊 摘要 土壤鉻污染是全球關注的環(huán)境問題朽寞。然而离例，生物炭和AM真菌接種物聯(lián)合應用對植物抗鉻性的影響尚...

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摘要 根系相關微生物在植物對環(huán)境脅迫的響應中發(fā)揮著重要作用岩瘦。然而，控制鹽脅迫植物與微生物之間相互作用的潛在機制卻知之甚少葵孤。該研究通過聚焦耐鹽植物野大豆(野生大豆)担钮，證明了以假...

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準備階段 安裝VennDetail包，首先需要安裝BiocManager包 if (!require("BiocManager", quietly = TRUE))#確認是否...

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基因的表達是dna-rna-蛋白,期間有轉錄水平調控箫津、轉錄后調控、翻譯后調控等多種調控機制影響該基因的表達. 所以蛋白水平高低的原因就可能是多方面的.蛋白表達多,可能是mrn...

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數(shù)據(jù)用的是KEGG的L2級的分類相對豐度 長這個樣子辆布，柱狀圖的x軸瞬矩，第一列是命名，第二列是分類锋玲，第三列是相對豐度 安裝包就不解釋了景用，直接讀取，安裝包的過程可以看其他的惭蹂，這幾個...

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這邊文章主要是針對Gephi中的節(jié)點一直為圓伞插，無法更改形狀的問題，這個導出的圖為png會顯示節(jié)點盾碗，PDF和SVG文件都沒有辦法顯示節(jié)點媚污，主要是因為添加的插件 Polygon ...

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Gephi在繪制微生物共現(xiàn)網(wǎng)絡圖的時候一般只能固定使用網(wǎng)絡的屬性進行染色，每次的OTU節(jié)點染色的時候都會隨機生成顏色廷雅，無法做到多個顏色的統(tǒng)一杠步，這篇文章可以解決固定染色的問題。...

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ggplot2包的目的是提供一個全面的榜轿、基于語法的幽歼、連貫一致的圖形生成系統(tǒng)，允許用戶創(chuàng)建新穎的谬盐、有創(chuàng)新性的數(shù)據(jù)可視化圖形甸私。 1、簡介ggplot2語法 下面將從一個例子來看看...

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library(permute) library(lattice) library(vegan) otu <- read.delim('D:/Adata/First/otu....

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#運行ggplot2 library(ggplot2) #讀取數(shù)據(jù) library(xlsx)#導入xlsx或者xls文件，其他文件不需要 workbook<- ("D:/A...

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論文 Microbiome differential abundance methods produce different results across 38 datase...