linux下的shell腳本（基本） 先說明以下內(nèi)容來自： http://c.biancheng.net/cpp/shell/ 叹放，C語言中文網(wǎng)胁勺，請大家支持原作窃款，點擊鏈接查看盈魁。...
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linux下的shell腳本（基本語法） -
如何創(chuàng)造/處理一個segmentation fault (core dumped)
segmentation fault (core dumped)是一個曾經(jīng)讓我非常頭疼的報錯，當然它還有一種中文形式女责，段錯誤(核心已轉移)。 這種錯誤可能會在各種程序中出現(xiàn)，...
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純二代測序從頭組裝基因組基因組組裝 基因組組裝一般分為三個層次丁屎，contig, scaffold和chromosomes. contig表示從大規(guī)模測序得到的短讀(reads)中找到的一致性序列。組...
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序列拼接 - Velvet
基因組測序數(shù)據(jù)的從頭組裝過程：測序讀段（reads) > contig > scaffold > chromosome 1.核心算法 基因組測序數(shù)據(jù)的從頭組裝的的核心算法主要...
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測序數(shù)據(jù)質(zhì)控和預處理之fastp
1. 引言 下機的FASTQ數(shù)據(jù)通常需要進行質(zhì)控和預處理旱眯，以保證下游分析輸?shù)臏蚀_性晨川。fastp軟件僅掃描數(shù)據(jù)文件一次，就可以完成FASTQC + cutadapt + T...
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使用fastp進行數(shù)據(jù)質(zhì)控
fastp是一款較新的數(shù)據(jù)質(zhì)控軟件删豺，接觸這個軟件也是由于目前市場的軟件各有功能但是功能都不是很全共虑，譬如最近接觸到一個RNAseq數(shù)據(jù)，質(zhì)量較差呀页，需要去除接頭而且含N較多妈拌，序列...
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【生信基礎】數(shù)據(jù)質(zhì)控軟件fastpfastp 在2018 發(fā)表于bioinformatics 具體文章地址如下：https://academic.oup.com/bioinformatics/article/...
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質(zhì)控軟件 fastp
注：本文全文摘選自知乎：fastp: 一款超快速全功能的FASTQ文件自動化質(zhì)控+過濾+校正+預處理軟件 1引言 各位做生信的小伙伴都知道，對于下機的FASTQ數(shù)據(jù)需要進行質(zhì)...
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fastp全新的數(shù)據(jù)質(zhì)控軟件各位做生信的小伙伴都知道蓬蝶，對于下機的FASTQ數(shù)據(jù)需要進行質(zhì)控和預處理尘分，以保證下游分析輸入的數(shù)據(jù)都是干凈可靠的。通常我們都是使用FASTQC等軟件進行質(zhì)控丸氛，使用cutadap...
