sample1 sample1基本測序信息統(tǒng)計 畫頻數(shù)分布直方圖 獲取一致性序列CCS 統(tǒng)計CCS信息 畫頻數(shù)分布直方圖 CCS分類 isoseq3 refine(去除plo...
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用肘方法確定 kmeans 聚類中簇的最佳數(shù)量 - 賞爾 - 博客園 KMeans 聚類中的超參數(shù)是 K,需要我們指定洪燥。K 值一方面可以結(jié)合具體業(yè)務(wù)來確定熔恢,另一方面可以通過肘...
寫在前面 本文主要參考生信小白2018[http://www.reibang.com/p/bb4281e6604e]與多啦A夢的時光機(jī)[https://www.jiansh...
近日脐湾,在做蛋白數(shù)據(jù)分析的時候看到一篇文章,里面進(jìn)行了表達(dá)趨勢的分析叙淌。感覺很有用秤掌,舉個例子,尤其是與時間發(fā)育或者疾病進(jìn)程相關(guān)的表達(dá)譜鹰霍,通過趨勢分析可以找到一些規(guī)律机杜,看出不同表達(dá)...
有些時候,很多分析明知道不能做衅谷,還不得不去做椒拗。比如,只有TPM值情況下的基因差異表達(dá)分析: 代碼來自一篇被刪掉的帖子获黔,估計他也覺得不能做wilcox.test 進(jìn)行 RNAs...
方法一:基于hmm模型的鑒定方法 1.準(zhǔn)備數(shù)據(jù)①下載擬南芥基因組fasta文件蚀苛、注釋文件gtf/gff3文件:ftp://ftp.ensemblgenomes.org/pub...
寫在前面 做基因功能的人都會特別注意基因上有什么功能結(jié)構(gòu)域,通常我們認(rèn)為玷氏,結(jié)構(gòu)域決定了這個基因的功能堵未。隨著高通量測序技術(shù)的發(fā)展,我們完全可以通過一級序列來預(yù)測該基因的結(jié)構(gòu)域盏触,...