我要偷偷內(nèi)卷，然后驚艷所有人！
發(fā)簡信
IP屬地：福建
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小王小王顽频，垃圾大王<br>
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全長轉(zhuǎn)錄組分析
sample1 sample1基本測(cè)序信息統(tǒng)計(jì) 畫頻數(shù)分布直方圖 獲取一致性序列CCS 統(tǒng)計(jì)CCS信息 畫頻數(shù)分布直方圖 CCS分類 isoseq3 refine(去除plo...
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用肘方法確定 kmeans 聚類中簇的最佳數(shù)量用肘方法確定 kmeans 聚類中簇的最佳數(shù)量 - 賞爾 - 博客園 KMeans 聚類中的超參數(shù)是 K，需要我們指定太闺。K 值一方面可以結(jié)合具體業(yè)務(wù)來確定糯景，另一方面可以通過肘...
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生信 | 構(gòu)建物種的OrgDb寫在前面 本文主要參考生信小白2018[http://www.reibang.com/p/bb4281e6604e]與多啦A夢(mèng)的時(shí)光機(jī)[https://www.jiansh...
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Bioinformatics <br>FAFU<br>吃吃吃
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基因或蛋白表達(dá)譜的時(shí)間趨勢(shì)分析---從趨勢(shì)尋找規(guī)律近日涨缚，在做蛋白數(shù)據(jù)分析的時(shí)候看到一篇文章，里面進(jìn)行了表達(dá)趨勢(shì)的分析策治。感覺很有用脓魏，舉個(gè)例子，尤其是與時(shí)間發(fā)育或者疾病進(jìn)程相關(guān)的表達(dá)譜通惫，通過趨勢(shì)分析可以找到一些規(guī)律茂翔，看出不同表達(dá)...
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2021-01-03TPM做差異表達(dá)分析
有些時(shí)候，很多分析明知道不能做奄侠，還不得不去做卓箫。比如，只有TPM值情況下的基因差異表達(dá)分析： 代碼來自一篇被刪掉的帖子垄潮，估計(jì)他也覺得不能做wilcox.test 進(jìn)行 RNAs...
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基因家族分析 | 基因家族成員鑒定(hmm模型＆同源blast)方法一：基于hmm模型的鑒定方法 1.準(zhǔn)備數(shù)據(jù)①下載擬南芥基因組fasta文件烹卒、注釋文件gtf/gff3文件：ftp://ftp.ensemblgenomes.org/pub...
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【HMMSCAN】使用pfam數(shù)據(jù)庫對(duì)多序列文件進(jìn)行結(jié)構(gòu)域注釋
寫在前面 做基因功能的人都會(huì)特別注意基因上有什么功能結(jié)構(gòu)域，通常我們認(rèn)為弯洗，結(jié)構(gòu)域決定了這個(gè)基因的功能旅急。隨著高通量測(cè)序技術(shù)的發(fā)展，我們完全可以通過一級(jí)序列來預(yù)測(cè)該基因的結(jié)構(gòu)域牡整，...
