寫在前面 以前總看到問題是，基因結(jié)構(gòu)可視化的問題；現(xiàn)在則變成了啟動子元件的預(yù)測或者說可視化。這本身比較簡單，也比較玄乎拐邪，所以我一直不是太樂意與別人討論。但學(xué)院今天斷網(wǎng)，手上的...
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植物啟動子-順式作用元件-批量提取-預(yù)測-可視化分析 -
TBtools | 地球最友好的 GFF3/GTF 序列提取工具無論是Windows颖御，MacOS, Linux桌面的用戶，你都可以也會使用凝颇。 寫在前面 伴隨基因組測序的普及潘拱，越來越多物種的基因組測序項目開展并報道，為科研工作者提供了更為全...
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零基礎(chǔ)多物種間共線性分析首先非常感謝Cj大神開發(fā)出來的TBtools生信工具拧略，為生信分析做圖帶來了極大的便利芦岂。作為生信小白，在做多物種間共線性分析時垫蛆，嘗試了多種方法禽最，苦于沒有計算機基礎(chǔ)，一直沒能完成...
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用TBtools袱饭，快速高效實現(xiàn)基因組共線性分析與可視化川无， 贊！寫在前面 對于沒有做過共線性分析的小伙伴虑乖，可以通過以下幾段內(nèi)容懦趋，了解一下，我為什么要費勁巴拉畫出這樣一張圖疹味。 除了基因組成的相似性,在不同基因組中基因排列順序的一致性更能夠體...
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基因家族分析——TBtools本次筆記分享主要參照 Y大寬和生信札記 的推文以及自己實際用過過程中的一些心得編寫仅叫！ 一帜篇、大致思路 也可以參見：基因家族分析[http://www.reibang.com/...
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保姆級教程：手把手教你畫出內(nèi)容豐富的基因結(jié)構(gòu)圖 （進化樹+CDD+UTR/CDS）寫在前面：在基因家族生信分析（二）這篇文章里，簡單提到了一種基因結(jié)構(gòu)繪制的方法诫咱，當(dāng)時是跟著視頻課做筆記坠狡，沒有實際操作。直到今天實際操作了一下遂跟，發(fā)現(xiàn)有很多需要注意的地方逃沿，今天就...
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PlantCARE預(yù)測植物啟動子-順式作用元件啟動子 啟動子是RNA 聚合酶識別、結(jié)合和開始轉(zhuǎn)錄的一段DNA 序列幻锁，它含有RNA 聚合酶特異性結(jié)合和轉(zhuǎn)錄起始所需的保守序列凯亮，多數(shù)位于結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄起始點的上游,啟動子本身不被...
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利用MegaX構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹Hi,大家好。對于做實驗的小伙伴來說哄尔，我們經(jīng)常需要構(gòu)建進化樹假消，那么很多人應(yīng)該都會選擇MEGA（Molecular Evolutionary Genetic Analysis）...
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如何利用NCBI預(yù)測基因的結(jié)構(gòu)域和保守位點1. 使用CD-Search工具來可以鑒定蛋白質(zhì)或者核酸序列內(nèi)的保守結(jié)構(gòu)域或功能單位。該工具位于NCBI中岭接。具體我們可以進入NCBI后選擇Conserved Domain然后...
