無論是Windows漱挚，MacOS, Linux桌面的用戶，你都可以也會使用。 寫在前面 伴隨基因組測序的普及凌蔬，越來越多物種的基因組測序項目開展并報道，為科研工作者提供了更為全...
IP屬地：山西
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TBtools | 地球最友好的 GFF3/GTF 序列提取工具 -
零基礎(chǔ)多物種間共線性分析首先非常感謝Cj大神開發(fā)出來的TBtools生信工具，為生信分析做圖帶來了極大的便利。作為生信小白欣尼，在做多物種間共線性分析時，嘗試了多種方法停蕉，苦于沒有計算機(jī)基礎(chǔ)愕鼓，一直沒能完成...
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研究生拒啰，常做實驗驯绎，生信小白完慧。
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用TBtools，快速高效實現(xiàn)基因組共線性分析與可視化， 贊屈尼！寫在前面 對于沒有做過共線性分析的小伙伴册着，可以通過以下幾段內(nèi)容，了解一下脾歧，我為什么要費(fèi)勁巴拉畫出這樣一張圖甲捏。 除了基因組成的相似性,在不同基因組中基因排列順序的一致性更能夠體...
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基因家族分析——TBtools本次筆記分享主要參照 Y大寬和生信札記 的推文以及自己實際用過過程中的一些心得編寫！ 一鞭执、大致思路 也可以參見：基因家族分析[http://www.reibang.com/...
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保姆級教程：手把手教你畫出內(nèi)容豐富的基因結(jié)構(gòu)圖 （進(jìn)化樹+CDD+UTR/CDS）寫在前面：在基因家族生信分析（二）這篇文章里，簡單提到了一種基因結(jié)構(gòu)繪制的方法兄纺，當(dāng)時是跟著視頻課做筆記大溜，沒有實際操作。直到今天實際操作了一下估脆，發(fā)現(xiàn)有很多需要注意的地方钦奋，今天就...
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PlantCARE預(yù)測植物啟動子-順式作用元件啟動子 啟動子是RNA 聚合酶識別、結(jié)合和開始轉(zhuǎn)錄的一段DNA 序列疙赠，它含有RNA 聚合酶特異性結(jié)合和轉(zhuǎn)錄起始所需的保守序列付材，多數(shù)位于結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)的上游,啟動子本身不被...
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利用MegaX構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹Hi,大家好。對于做實驗的小伙伴來說圃阳，我們經(jīng)常需要構(gòu)建進(jìn)化樹厌衔，那么很多人應(yīng)該都會選擇MEGA（Molecular Evolutionary Genetic Analysis）...
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如何利用NCBI預(yù)測基因的結(jié)構(gòu)域和保守位點(diǎn)1. 使用CD-Search工具來可以鑒定蛋白質(zhì)或者核酸序列內(nèi)的保守結(jié)構(gòu)域或功能單位。該工具位于NCBI中捍岳。具體我們可以進(jìn)入NCBI后選擇Conserved Domain然后...
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TBtools基因家族分析詳細(xì)教程（1）寫在前面：非常感謝CJ開發(fā)出如此強(qiáng)大的TBtools工具葵诈，作者詳細(xì)講解了基因家族的分析過程和意義，課程購買地址祟同，講的很棒作喘，可以試聽。 一共分為4個部分TBtools基因家族分...
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InterPro 注釋和結(jié)果可視化一、InterPro數(shù)據(jù)庫簡介 Interpro是集成了蛋白質(zhì)家族砖顷、結(jié)構(gòu)域和功能位點(diǎn)的非冗余蛋白質(zhì)特征序列數(shù)據(jù)庫贰锁。 Interpro數(shù)據(jù)庫成員包括Coils 、Gene3D滤蝠、...
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ensemble使用教程ensemble數(shù)據(jù)庫的功能非常多豌熄，在此主要介紹用ensemble下載目標(biāo)物種的全基因組文件和基因注釋文件，以及如何用ensemble進(jìn)行blast
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一文掌握R包DESeq2的差異基因分析過程轉(zhuǎn)錄組測序的最直接目的芯肤，就是設(shè)法尋找組間顯著表達(dá)變化的基因巷折，解釋基因表達(dá)水平的變化對生物功能的影響。例如崖咨，腫瘤患者與正常人群相比哪些編碼蛋白或非編碼RNA分子發(fā)生了失調(diào)锻拘，這些...
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科研小白署拟，努力搞科研，發(fā)文章中歌豺。這個平臺算是我的學(xué)習(xí)筆記吧芯丧！
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STEM軟件分析基因表達(dá)模式最近有一批轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)缨恒，其實不是時間序列的數(shù)據(jù)，而是從低到高有4個梯度的Al濃度處理的數(shù)據(jù)轮听，每個三個重復(fù)骗露，共有12個數(shù)據(jù)，想著看一下4個梯度處理下基因表達(dá)的模式血巍，使用了STEM...
