方法1绒极，下載包后解壓则涯，ubunt20.04 Peer的包鏈接： 方法2 得到殘差后用python計算z-score
發(fā)簡信
IP屬地：山東
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ASE（等位基因特異性表達） —— 完整流程
前段時間磕洪，接了老師一個等位基因特異性表達的任務，前后再加上其他的分析帶著做，再捋流程，拖拖拉拉也用了小一個月，終于從原始測序數(shù)據(jù)腐晾，得到了最終的那張table叉弦，具體的內(nèi)容基本已...
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CFVisual繪制Motif+基因結(jié)構(gòu)+結(jié)構(gòu)域+進化樹+啟動子圖的單獨或組合圖1. 軟件簡介 CFVisual_V2.1軟件是一款借助Python語言的matplotlib庫和PySide2庫進行生物序列結(jié)構(gòu)繪圖的數(shù)據(jù)可視化軟件，主要用于生物信...
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PlantCARE預測植物啟動子-順式作用元件啟動子 啟動子是RNA 聚合酶識別藻糖、結(jié)合和開始轉(zhuǎn)錄的一段DNA 序列淹冰，它含有RNA 聚合酶特異性結(jié)合和轉(zhuǎn)錄起始所需的保守序列，多數(shù)位于結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄起始點的上游,啟動子本身不被...
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9.4 GWAS：顯著性閾值確定——GEC常用的顯著性閾值確定方法是：Bonferroni correction = 顯著性水平（0.01/0.05）/檢驗次數(shù)（number of detected markers）...
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R語言中dplyr包join函數(shù)之目前我看到過的最形象的教程所涉及的函數(shù) Mutating Joins: inner_join(), left_join(), right_join(), full_join() Filtering J...
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phASER 計算等位基因表達
等位基因的特定表達（allelespecificexpression巨柒，ASE）數(shù)據(jù)是后續(xù)分多分析的基礎樱拴。利用它可以識別印記基因、研究蛋白截斷變異以及用于量化順式（cis）調(diào)...
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Read count洋满、CPM晶乔、 RPKM、FPKM和TPM的區(qū)別1. 為什么我們要進行Normalization 測序深度：某些低表達量的基因只有在較高的測序深度時才能檢測到牺勾。一般而言正罢，隨著測序深度的增加，基因種類以及可變剪接體的數(shù)目也會...
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RNA-seq中的那些統(tǒng)計學問題（二）FPKM/RPKM之外的那些標準化方法目錄 1. 標準化1.1. House-keeping gene(s)1.2. spike-in1.3. CPM1.4. TCS1.5. Quantile1.6. Media...
