發(fā)簡信
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Perl語言是生信學習的基礎(chǔ)需要妓柜。
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生信相關(guān)的perl知識收集
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@王雪琴_e546 分開做
系統(tǒng)發(fā)育比較分析—R
系統(tǒng)發(fā)育樹是研究物種進化歷史必不可少的信息千所，我們可以利用它得到一些重要歷史線索，如： 生物多樣性（物種形成或滅絕）蒜埋； 物種性狀進化與多樣化（Character evoluti...
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「基因組」基因共線性可視化（待更新）軟件 1.JCVI2.NGenomeSyn3.synvisio在線工具：鏈接 https://synvisio.github.io/[https://synvisio.git...
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genblastg和genewise鑒定缺失基因
基于組裝好的基因組淫痰，例如某一個基因在該基因組中無注釋，需檢查是否為注釋錯誤整份，還是該基因本身缺失待错。 軟件：genblastg和genewise genblastg下載地址：ht...
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接上，pcoc檢測氨基酸性質(zhì)的趨同
pcoc檢測 step1. 處理樹文件烈评；將第2步生成的02_Trees文件夾拷貝到當前目錄火俄，并修改為.txt結(jié)尾 step2：處理序列文件 step3: 準備需要檢測物種的文...
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野生動物調(diào)查方法
主要步驟 1. 確定調(diào)查目標 調(diào)查什么動物（魚類、兩棲爬行動物讲冠、鳥類或哺乳動物） 調(diào)查動物什么（多樣性瓜客、種群數(shù)量、棲息地） 調(diào)查范圍時多大（全國竿开、全省谱仪、保護區(qū)） 采用什么方法...
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僅作個人筆記 - 基于fithic的輸出結(jié)果統(tǒng)計染色體體間顯著互作的密度0.僅作個人筆記使用意思就是只考慮我能不能看懂 fithic的安裝、使用這里略去假定已經(jīng)運行完了fithic 輸入文件長這樣: 輸出文件: 最后畫一個核型圖 核型圖的繪制參考...
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WGDI - 推斷祖先核型0.僅作個人筆記使用意思就是只考慮我能不能看懂具體每個參數(shù)的含義參照官方文檔, 這里全部用默認參數(shù)https://wgdi.readthedocs.io/en/latest/...
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ChromoSSE: 染色體數(shù)目進化/Chromosome Number Evolutionhttps://github.com/wf8/ChromoSSE[https://github.com/wf8/ChromoSSE] 1.輸入文件的準備.兩個文件, 一個是進...
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2023-09-21 PSMC可以評估有效群體大小的原因
介紹這個軟件的概念前胳搞，我需要先解釋一個概念最近共同祖先時間（the time since the most recent common ancestor卸例，TMRCA）称杨。當我們...
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隨筆 | 十年之后，我們?nèi)匀粵]能坐在一起喝上一口啤酒時間過得很快筷转，或許可以說姑原，從7月底到現(xiàn)在，我仍然沒有忙完手頭的事情呜舒。上午收到消息時锭汛，我仍然在趕著項目，有時候袭蝗，不知道是對是錯唤殴。多算一年半年，與基友「醬油」認識可能也是10年到腥。...
