一、寫在前面 扣扣群:559758504(目前無需驗證柔滔,一鍵即可加入) 如果你不想學(xué)溢陪,老板又催著要,你可以加群私聊我尋求幫助( $ _ $ )睛廊,但還是自己學(xué)嬉愧,知識都是自己的。...
作者:May審稿:童蒙編輯:amethyst 前言 基因組轉(zhuǎn)座子(TE)注釋過程中喉前,對于RepeatModeler這種denovo注釋的得到的轉(zhuǎn)座子往往不能進行分類没酣,因此對T...
生成那三個中間文件后就不運行了 結(jié)果明顯沒跑完啊 怎么處理
使用EDTA進行TE注釋一句話評價:重復(fù)序列注釋用EDTA就完事了。 簡介 EDTA, 全稱是 Extensive de-novo TE Annotator, 一個綜合性的流程工具卵迂,它整合了目前LT...
deepte該咋安裝啊 conda能裝嗎 我試了半天不動彈
轉(zhuǎn)座子分類軟件deepTE簡介作者:May審稿:童蒙編輯:amethyst 前言 基因組轉(zhuǎn)座子(TE)注釋過程中裕便,對于RepeatModeler這種denovo注釋的得到的轉(zhuǎn)座子往往不能進行分類,因此對T...
@EthanYau 咋提取啊
edgeR中三種標(biāo)準(zhǔn)化方法TMM\UQ\RLE的比較關(guān)于RNA-seq中的reads count標(biāo)準(zhǔn)化處理的方法匯總庆揩,請先看看這篇:當(dāng)我們在說RNA-seq reads count標(biāo)準(zhǔn)化時俐东,其實在說什么? 本文集中討論常用的e...
edgeR 命令后那個TMM矩陣怎么提取
理論 | edgeR -- TMM normalization 詳細計算過程最近在看差異分析當(dāng)中原始read counts是如何被校正的订晌,自然就不會放過差異分析的經(jīng)典之一 —— edgeR. edgeR使用的校正方法稱為trimmed mean of...