學(xué)習(xí)R的第一步當(dāng)然是安裝啦佣耐！ 什么是R届慈？ R是用于統(tǒng)計分析、繪圖的語言和操作環(huán)境魂挂。R是屬于GNU系統(tǒng)的一個自由、免費肉康、源代碼開放的軟件能岩，它是一個用于統(tǒng)計計算和統(tǒng)計制圖的優(yōu)秀工...
發(fā)簡信
IP屬地：吉林
-
R的安裝（Windows）新人小白請多指教 -
檢驗數(shù)據(jù)是否服從正態(tài)分布
在SPSS中，正態(tài)分布的檢驗方法有：計算偏度系數(shù)（Skewness）和峰度系數(shù)（Kurtosis）株灸、Kolmogorov-Smirnov檢驗（KS檢驗或D檢驗）崇摄、Shapir...
-
遺傳統(tǒng)計|MSMC推斷群體歷史動態(tài)Multiple Sequentially Markovian Coalescent (MSMC)是一種利用馬爾可夫模型推斷群體動態(tài)歷史和群體結(jié)構(gòu)的算法。能夠通過輸入基因組序...
-
RNA seq上游分析（簡潔版）
環(huán)境配置 質(zhì)檢 去接頭 比對 得到count值 最終會在目標(biāo)文件夾下面獲得兩個文件慌烧，counts.txt和counts.txt.summary逐抑。在R中進(jìn)行ID轉(zhuǎn)換即可。
-
STRING中做蛋白質(zhì)互作（PPI）網(wǎng)絡(luò)調(diào)控圖及GO屹蚊、KEGG分析1.什么是蛋白互作厕氨？ 在轉(zhuǎn)錄調(diào)控相關(guān)的文獻(xiàn)中，我們經(jīng)常能夠看到這樣的蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)（proteinprotein interaction network汹粤，PPInetwo...
-
GWAS全基因組關(guān)聯(lián)分析流程（BWA+samtools+gatk+Plink+Admixture+Tassel）
我梳理了GWAS全基因組關(guān)聯(lián)分析的整個流程命斧，并提供了基本的命令，用到的軟件包括BWA嘱兼、samtools国葬、gatk、Plink、Admixture汇四、Tassel等接奈，在此分享出來...
-
iTAK：在線預(yù)測全基因組轉(zhuǎn)錄因子TF，轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子TR與蛋白激酶PK前言 康奈爾大學(xué)船殉，F(xiàn)eiLab的一個預(yù)測工具鲫趁。 iTAK 是依賴于數(shù)據(jù)庫的用于從蛋白質(zhì)或核苷酸序列中識別植物轉(zhuǎn)錄因子 (TF)、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子 (TR) 和蛋白激酶 (PK)利虫，...
-
一文了解Count挨厚、FPKM、RPKM糠惫、TPM | 相互間的轉(zhuǎn)化 | 收藏教程
PS：如果你需要本教程的練習(xí)代碼和文檔疫剃，可以在公眾號回復(fù)“20220122”即可獲得。 前言： 今早看到一篇博文硼讽，提到了FPKM與TPM間轉(zhuǎn)化巢价。我自己也系統(tǒng)的再次進(jìn)行整理一下...
-
Linux處理文本的三駕馬車-grep命令及使用例子Linux處理文本的三駕馬車為 ? grep? sed? awk Linux處理文本的第一駕馬車——grep命令 以下主要記錄grep的用法，后續(xù)會把另外兩架馬車（sed和a...
