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腦轉(zhuǎn)移癌相關(guān)髓系細(xì)胞大腦很久以來都被認(rèn)為是一個(gè)免疫豁免器官病附，其含有的免疫細(xì)胞含量較少唉匾，但在一些病例情況下，例如腫瘤搁进，就會導(dǎo)致免疫細(xì)胞的異常浸潤，其中從血液中遷徙過來...
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腦部腫瘤的免疫微環(huán)境圖譜2020年蹄皱，來自瑞士洛桑大學(xué)的Johanna A Joyce團(tuán)隊(duì)通過全面對比不同類型腫瘤的免疫微環(huán)境旧噪，展現(xiàn)了不同類型腦腫瘤的免疫浸潤特點(diǎn)，回答了...
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GATK下游VCF maf可視化
VCF可以通過不同的上游分析獲得，在格式上又有一些不同赦抖，盲目轉(zhuǎn)化會帶來很多問題舱卡。查看VCF文件內(nèi)容可知是通過GATK上游處理得到的。 為了對變異...
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RNA seq上游分析（簡潔版）
環(huán)境配置 質(zhì)檢 去接頭 比對 得到count值 最終會在目標(biāo)文件夾下面獲得兩個(gè)文件队萤，counts.txt和counts.txt.summary轮锥。...
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單細(xì)胞測序揭示巨噬細(xì)胞和小膠質(zhì)細(xì)胞動態(tài)競爭關(guān)系今天介紹一篇有關(guān)于單細(xì)胞揭示在膠質(zhì)母細(xì)胞瘤中，大腦原位的髓系細(xì)胞（小膠質(zhì)細(xì)胞）和血液來源的單核-巨噬細(xì)胞的動態(tài)競爭關(guān)系要尔。 背景 免疫檢查點(diǎn)抑制劑...
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非小細(xì)胞肺癌微環(huán)境免疫模式用以腫瘤分型和病人分層2021年舍杜，Leader等人通過目前最大的非小細(xì)胞肺癌的單細(xì)胞測序和CITE-seq，對非小細(xì)胞肺癌的微環(huán)境進(jìn)行了多組學(xué)的分析赵辕，最終構(gòu)建了一個(gè)包...
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乳腺癌骨轉(zhuǎn)移微環(huán)境輔助精準(zhǔn)治療最近看到一篇單細(xì)胞與臨床相結(jié)合的文章既绩，通過乳腺癌骨轉(zhuǎn)移的腫瘤微環(huán)境，提示腫瘤的精準(zhǔn)治療还惠。發(fā)表在Ann Oncol. 作為一個(gè)臨床醫(yī)生饲握，本文的實(shí)驗(yàn)...
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GSE120974多組學(xué)分析復(fù)現(xiàn)0.數(shù)據(jù)介紹 這是一篇發(fā)表在Cancer Cell 2019 Sep的文章——Single-Cell Transcriptomics in Me...
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001-單細(xì)胞時(shí)序性追蹤探究肺癌中PD-1療法對耗竭T細(xì)胞的效應(yīng)本文是北大張澤民教授團(tuán)隊(duì)2022年的新作，通過T細(xì)胞譜系追蹤的方式吸重，探究PD-1療法對于肺癌中免疫微環(huán)境的影響互拾。 背景 免疫檢查點(diǎn)抑制劑通過阻滯...