請(qǐng)教跟K means有啥區(qū)別和優(yōu)勢(shì)铁瞒,謝謝
一致性聚類ConsensusClusterPlus介紹 一致性聚類是一種為確定數(shù)據(jù)集中可能的聚類的數(shù)量和成員提供定量證據(jù)的方法势似,例如作為微陣列基因表達(dá)。這種方法在癌癥基因組學(xué)中得到了廣泛應(yīng)用推穷,在那里發(fā)現(xiàn)了新的疾病分子亞類心包。 ...
請(qǐng)教非配對(duì)樣本 如何進(jìn)行差異基因分析?謝謝
從TCGA表達(dá)矩陣?yán)锊鸪雠鋵?duì)樣本0.需求 TCGA里的數(shù)據(jù)tumor多normal少馒铃,想要挑選出配對(duì)樣本進(jìn)行差異分析蟹腾。(并不是說必須挑配對(duì)樣本才能做哦,直接做也是可以的) 1.數(shù)據(jù) 這里使用的數(shù)據(jù)是TCGA...
最近在學(xué)習(xí)芬蘭CSC-IT科學(xué)中心主講的生物信息課程(https://www.csc.fi/web/training/-/scrnaseq)視頻区宇,官網(wǎng)上還提供了練習(xí)素材以及詳...
1. 概述 單樣本基因集富集分析(single sample gene set enrichment analysis, ssGSEA)娃殖,是GSEA方法的擴(kuò)展,主要是針對(duì)單個(gè)...
Inferring tumour purity and stromal and immune cell admixture from expression data.芬首,NC,...
更新日期:2018/3/13 這里匯總一些生信分析和數(shù)據(jù)可視化相關(guān)的推文或筆記,為知筆記里存的東西太雜太亂桐愉,花了一天的時(shí)間初步整理了下财破。點(diǎn)擊跳轉(zhuǎn)的是為知筆記提供的鏈接,可能需...
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析系列教程 sc-RAN-seq 數(shù)據(jù)分析||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial[https://www.jians...