RepeatMasker是重復(fù)序列檢測的常用工具渔期，通過與參考數(shù)據(jù)庫的相似性比對來準(zhǔn)確識別或屏蔽基因組中的重復(fù)序列榜贴，屬于同源預(yù)測注釋的方式蜀肘。下文除了RepeatMasker的使...
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基因組重復(fù)序列檢測：RepeatMasker的安裝及使用 -
羨慕先生
病毒正二十面體對稱結(jié)構(gòu)：病毒學(xué)常見概念 I
我對病毒學(xué)的喜愛咬最，受先生影響戒努。雖拜先生門下千扶，但這些年與先生相處時(shí)間并不多词爬。有時(shí)匆匆見一面秃嗜，先生無意間提及的一個(gè)病毒學(xué)概念，我都會花不少時(shí)間去查閱資料顿膨，以加深印象锅锨。正如今天我要...
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病毒正二十面體對稱結(jié)構(gòu)：病毒學(xué)常見概念 I
我對病毒學(xué)的喜愛橡类，受先生影響。雖拜先生門下芽唇，但這些年與先生相處時(shí)間并不多。有時(shí)匆匆見一面取劫，先生無意間提及的一個(gè)病毒學(xué)概念匆笤，我都會花不少時(shí)間去查閱資料，以加深印象谱邪。正如今天我要...
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蛋白質(zhì)工程
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用二代測序分析軟件來跑一代的結(jié)果
2013年左右书蚪，二代測試開始崛起喇澡，不到一年大有橫掃測序行業(yè)的勢頭。記得當(dāng)時(shí)二代測序服務(wù)公司的業(yè)務(wù)員到我們實(shí)驗(yàn)室推銷業(yè)務(wù)殊校，宣傳冊十分“高大上”的樣子晴玖，一問價(jià)格，內(nèi)心直哆嗦为流。但當(dāng)...
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RoseTTAFold-蛋白質(zhì)預(yù)測的“平凡之路”在個(gè)人筆記本win10自帶子linux系統(tǒng)下呕屎，運(yùn)行基于CPU運(yùn)算的RoseTTAFold 避開uniref30、BFD這兩個(gè)超大數(shù)據(jù)包的下載及解壓 提供便捷的pyRosett...
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干貨 | 全基因組CRISPR文庫篩選數(shù)據(jù)分析——MAGeCKFlute近年來敬察，全基因組CRISPR文庫篩選技術(shù)被廣泛應(yīng)用于腫瘤及病毒相關(guān)調(diào)控因子篩選秀睛。通過同時(shí)sgRNA文庫同時(shí)敲除全基因組的不同基因，經(jīng)流式或藥物篩選目的細(xì)胞表型莲祸，并擴(kuò)增sgRN...
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蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)總覽 1）氨基酸序列2）周期性的結(jié)構(gòu)構(gòu)象3）整條多肽鏈的三維空間結(jié)構(gòu)4）多個(gè)亞基形成的復(fù)合體結(jié)構(gòu) 蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu) 二級結(jié)構(gòu)為蛋白質(zhì)經(jīng)過折疊蹂安，構(gòu)成的規(guī)則的片段。 ...
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@yutang12 應(yīng)該是的虫给，帶有預(yù)后數(shù)據(jù)的腫瘤患者樣本
基于R對TCGA患者臨床數(shù)據(jù)整理和Cox分析
一藤抡、數(shù)據(jù)整理 1 導(dǎo)入數(shù)據(jù) 利用data.table包導(dǎo)入數(shù)據(jù)，以LUAD為例 2 選擇感興趣的臨床信息 一般常規(guī)項(xiàng)包括submitter_id抹估，vital_status缠黍，t...
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Golden Gate，質(zhì)粒改造的王者
前期文章： 我們用兩篇文章的篇幅大概講了一遍質(zhì)粒骨架及其各個(gè)要素的介紹：解剖式學(xué)習(xí)一個(gè)質(zhì)粒結(jié)構(gòu)--update[http://www.reibang.com/p/e6c58...
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我超药蜻，牛逼
Golden Gate瓷式，質(zhì)粒改造的王者
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生物信息python 入門題 初級至進(jìn)階
本文水平有點(diǎn)low廊驼，本來不打算寫這么低水平的文章，怎奈我的python水平就在這么low的水平惋砂。以此貼記錄初試python解決生信簡單問題的學(xué)習(xí)過程妒挎，也算讓自己看清楚自己py...
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搬磚的工人<br>
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RNA速率：使用Seurat的結(jié)果做RNA velocity參考鏈接:https://github.com/velocyto-team/velocyto.R[https://github.com/velocyto-team/veloc...
