導(dǎo)讀 平時(shí)看文章膝捞，特別是組學(xué)文章肌访，作者在文末都會(huì)提供其研究材料中高通量測(cè)序數(shù)據(jù)的下載鏈接近刘，如果平時(shí)想練手的話匠抗，下載這些數(shù)據(jù)是最好不過了灭翔，下面我就總結(jié)下如何從GEO和SRA中下...
發(fā)簡(jiǎn)信
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如何下載文章提供的測(cè)序數(shù)據(jù) -
全基因組關(guān)聯(lián)分析學(xué)習(xí)資料（GWAS tutorial）
前言 很多人問我有沒有關(guān)于全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS）原理的書籍或者文章推薦头滔。 其實(shí)我個(gè)人覺得蝠检，做這個(gè)分析沐鼠，先從跑流程開始，再去看原理叹谁。 為什么這么說呢饲梭，因?yàn)閷?duì)于初學(xué)者來說，...
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m6A甲基化對(duì)我來說就是好新鮮
前言 俗話說“文獻(xiàn)是最好的老師”焰檩，但是隔行如隔山憔涉，在科研界，隔著一個(gè)領(lǐng)域就有一個(gè)巨大的鴻溝析苫。就比如就算做腫瘤研究的人兜叨，看免疫學(xué)領(lǐng)域的文章還是會(huì)頭皮發(fā)麻穿扳，看到總是記不住的CD4...
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使用clusterProfiler包對(duì)非模式生物進(jìn)行GO和KEGG的富集分析
clusterProfiler包是Y叔開發(fā)的一個(gè)強(qiáng)大的能進(jìn)行多種功能富集的R包，對(duì)于有OrgDb或AnnotationHub中收錄的物種進(jìn)行GO和KEGG的富集分析非常的方便...
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無參轉(zhuǎn)錄組分析：使用 Trinity 進(jìn)行轉(zhuǎn)錄本拼接（參考腳本）1国旷，參考腳本： nohup /home/zxd/software/trinityrnaseq-Trinity-v2.4.0/Trinity --seqType fq --ma...
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和你息息相關(guān)——國(guó)自然基金標(biāo)題爬取寫在前面 幾乎每年的8月份矛物，都是科研大神們比較關(guān)注的日子，因?yàn)樽约耗瓿蹩嘈慕?jīng)營(yíng)的基金申請(qǐng)結(jié)果即將揭曉跪但。那么究竟花落誰家履羞，其實(shí)早有定數(shù)（當(dāng)然要建立在通宵達(dá)旦的碼字以及契合審稿人...
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不出Rstudio, 實(shí)現(xiàn)從多序列比對(duì)到畫進(jìn)化樹本文是對(duì)前幾天的打臉打臉之處就在于發(fā)現(xiàn)了muscle的R包，從此不用再為序列比對(duì)東奔西跑—— Step 1. 從基因名拿到序列 這一步用到的包：biomaRt 屡久，選擇用sym...
