一叽唱、 簡(jiǎn)述 ? ? 為了從基因的表達(dá)水平中得到更加具體直觀的生物學(xué)功能變化的信息屈呕,多種基于已知的基因集的分析方法應(yīng)運(yùn)而生。其中棺亭,基因集分析(Gene Set Analysis...
本節(jié)概覽1. WGCNA基本概念:定義纪吮、關(guān)鍵術(shù)語、基本流程萎胰、一些注意事項(xiàng)2. WGCNA運(yùn)行:?輸入數(shù)據(jù)準(zhǔn)備①判斷數(shù)據(jù)質(zhì)量碾盟,繪制樣品的系統(tǒng)聚類樹②挑選最佳閾值power③ 構(gòu)...
最近課題原因需要下載TCGA項(xiàng)目的SNP數(shù)據(jù)锨推,按照以前的經(jīng)驗(yàn)直接進(jìn)TCGA下一個(gè)整合的就好攀细,但現(xiàn)在更新之后SNP數(shù)據(jù)變成和count數(shù)據(jù)一樣是按照樣本存放的,因此下載后需要整...