最近實(shí)在太忙了重挑，好久沒有更新我們的簡書了，今天抽空無論如何也要更新。 示例：查詢PDCD1在各個泛癌細(xì)胞系中表達(dá)情況沾歪。 首先我們打開我們的CCLE數(shù)據(jù)庫上網(wǎng)頁蛀醉，網(wǎng)址走起饲齐，如果...
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CCLE查詢基因在細(xì)胞系中表達(dá) -
單基因TCGA的Cox森林圖怎么畫才好看首先調(diào)取Xena網(wǎng)頁的TCGA數(shù)據(jù)做Cox生存分析爽待，數(shù)據(jù)可以通過hiplot官網(wǎng)自主研發(fā)的ucsc-xena-shiny直接在線獲取訪問https://hiplot.com....
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GWAS - 3 多種算法結(jié)果的結(jié)合處理算法 （補(bǔ)充）無意看到一篇中文文章，并且寫出了多種算法珠十，這里總結(jié)一下料扰。 1 得到的數(shù)據(jù)分三種情況 1 完全列表（full list, FL）: 得到的各結(jié)果為完整SNP列表（并且每個為1個...
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Seurat4.0系列教程4：整合分析scRNA-seq整合簡介 對兩個或兩個以上單細(xì)胞數(shù)據(jù)集的整合分析提出了獨(dú)特的挑戰(zhàn)。特別是焙蹭，在標(biāo)準(zhǔn)工作流下记罚，識別存在于多個數(shù)據(jù)集中的基因可能存在問題。Seurat v4 包括...
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TCGA數(shù)據(jù)挖掘筆記1生信技能樹2021數(shù)據(jù)挖掘線上課筆記，需要結(jié)合課程講解服用 TCGA下載數(shù)據(jù)的方法-gdc-client（軟件名）：需要寫命令運(yùn)行姿搜，官方下載的數(shù)據(jù)寡润，下載的數(shù)據(jù)是零散的捆憎，每個病...
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ggplot2繪制一個高端的venn圖
venn圖在論文中的作用與地位也許不如其它圖形那么重要，因此本文主要不是教大家如何畫一個高端的venn圖梭纹，而是通過整個畫圖過程中的代碼來介紹一些重要的畫圖函數(shù)而已躲惰，希望各位觀...
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利用String數(shù)據(jù)庫和Cytoscape軟件繪制蛋白交互網(wǎng)絡(luò)（PPI）Summary String數(shù)據(jù)庫:https://www.string-db.org 是研究網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)中蛋白質(zhì)相互作用的一個常用數(shù)據(jù)庫础拨，截止今天，已經(jīng)更新到11.0版本绍载。 ...
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手把手教你繪制火山圖前面我通過視頻給大家講解過?火山圖怎么看[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp.weixin.qq.com/s%3F__biz...
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引物設(shè)計(jì)原則 及 Primer Premier 6 批量引物設(shè)計(jì)本文來源：互聯(lián)網(wǎng)击儡，侵權(quán)刪 篇一：引物設(shè)計(jì)原則 剛做實(shí)驗(yàn)的同學(xué)塔沃，很多時候希望別人幫自己設(shè)計(jì)好引物，其實(shí)這種方式是不可取的阳谍，首先是高估了引物設(shè)計(jì) 的難度蛀柴，其次也自己的實(shí)驗(yàn)別人了解...
