來(lái)自老大嗶哩嗶哩-生信技能樹的R語(yǔ)言視頻-P8 任意基因任意癌癥表達(dá)量分組的生存分析的學(xué)習(xí)筆記挂签。如下鏈接可直接跳轉(zhuǎn)視頻https://www.bilibili.com/vid...
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生信技能樹的R語(yǔ)言視頻-P8 任意基因任意癌癥表達(dá)量分組的生存分析
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R基礎(chǔ)-08.任意基因任意癌癥表達(dá)量分組的生存分析2019-07-17R基礎(chǔ)-08.任意基因任意癌癥表達(dá)量分組的生存分析 參考視頻【生信技能樹】生信人應(yīng)該這樣學(xué)R語(yǔ)言代碼為自己學(xué)習(xí)總結(jié) 由于工作上的一些事情疤祭，R基礎(chǔ)學(xué)習(xí)斷更快一周了盼产，今天補(bǔ)起 1...
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GO注釋結(jié)果整理對(duì)于非模式生物或者無(wú)參考基因組的項(xiàng)目，經(jīng)常需要進(jìn)行基因的功能注釋勺馆，而GO注釋是基因功能注釋的重要部分戏售。有很多軟件能夠獲得GO注釋的信息，例如interproscan草穆、eggn...
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GO/KEGG富集分析及R包繪圖（氣泡圖/條形圖）導(dǎo)讀 利用富集分析灌灾，我們可以把很多看著雜亂的差異基因總結(jié)出一個(gè)比較整體反應(yīng)事件發(fā)生的概述性的句子。 例如：TP53信號(hào)通路和胃癌的發(fā)生有關(guān)悲柱。而不是說(shuō)BAX锋喜、BID、ABL1豌鸡、...
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R語(yǔ)言學(xué)習(xí)-富集分析泡泡圖回應(yīng)
R語(yǔ)言學(xué)習(xí)-富集分析泡泡圖剛一出品嘿般，Y叔就說(shuō)有硬傷。Y叔是著名富集分析軟件clusterprofiler的原創(chuàng)涯冠，而且軟件內(nèi)集成dotplot,enrichmap,cnetma...
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day27 ChIP-seq 對(duì)peak進(jìn)行注釋R語(yǔ)言ChIPseeker包學(xué)習(xí)linux常用命令炉奴，并且實(shí)戰(zhàn)ChIP-seq已經(jīng)一個(gè)月了。現(xiàn)在需要用R包ChIPseeker進(jìn)行注釋蛇更，發(fā)現(xiàn)R已經(jīng)忘了大半瞻赶。補(bǔ)課R語(yǔ)言。派任。對(duì)peak的注釋分為兩個(gè)部分——結(jié)...
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超詳細(xì)ggmaplot繪制差異基因火山圖這次和大家分享下利用ggmaplot繪制差異基因篩選后的火山圖砸逊，用到的基因集是ggpubr里面自帶的數(shù)據(jù)集diff_express數(shù)據(jù)集 可以看到basemean為所有樣本數(shù)...
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使用蛋白ID如何進(jìn)行KEGG和GO富集分析事由起因 昨天，有個(gè)童鞋咨詢?nèi)绾问褂玫鞍譏D進(jìn)行功能富集分析掌逛，功能富集分析主要是KEGG和GO师逸。 思路 蛋白ID轉(zhuǎn)UniProt數(shù)據(jù)庫(kù)ID UniProt數(shù)據(jù)庫(kù)ID轉(zhuǎn)KEGG...
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R語(yǔ)言繪制環(huán)狀熱圖實(shí)操1# rm(list=ls())#clear Global Environment# setwd('F:\\RStudio\\RStudio_workPath\\heatmap...
