1 Bedtools:一個(gè)強(qiáng)大的基因組算法工具集 Bedtools是由猶他大學(xué)昆蘭實(shí)驗(yàn)室開(kāi)發(fā)的基因組算法工具集,它堪稱是基因組分析工具中的瑞士軍刀汹想。Bedtools可以對(duì)基因...
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CpG Shores 指的是位于CpG island上下游2kb 以內(nèi)的區(qū)域璧诵;CpG Shelves指的是位于CpG shores 上下游2kb以內(nèi)的區(qū)域摹芙。
應(yīng)該一個(gè)是上游,一個(gè)是下游吧纯路?
甲基化芯片注釋中的CpG shores, open sea 是什么
首先推薦Kobashttp://kobas.cbi.pku.edu.cn/kobas3/genelist/[http://kobas.cbi.pku.edu.cn/kobas...
經(jīng)常我們會(huì)遇到gff文件要處理。比如用MCScanX時(shí)就要這么處理:第一列為染色體腔彰,第二列為geneID叫编,第三,四列為基因的起始和終止的位置霹抛。如下圖: 這里染色體怪怪的先不管...
旁系同源基因簡(jiǎn)單來(lái)說(shuō)就是同一物種內(nèi)搓逾,通過(guò)基因復(fù)制產(chǎn)生的不同的兩種基因。 計(jì)算直系同源的辦法網(wǎng)上已經(jīng)很詳細(xì)杯拐,今天我來(lái)補(bǔ)充一下計(jì)算旁系同源基因ks的辦法霞篡。 最簡(jiǎn)單方法1 用wg...
文章分別引用自:網(wǎng)易云課堂《用Python自動(dòng)辦公世蔗,做職場(chǎng)高手》網(wǎng)址:https://study.163.com/course/introduction/1006277004...
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請(qǐng)問(wèn)您指的官方文檔是《MicroRNA targets in Drosophila》這篇文章嗎寸爆?如果不是能否告訴我下,謝謝
miRanda和mirSVR:預(yù)測(cè)miRNA結(jié)合位點(diǎn)的工具歡迎關(guān)注”生信修煉手冊(cè)”! 預(yù)測(cè)miRNA結(jié)合位點(diǎn)的工具很多盐欺,以TargetScan為代表的工具赁豆,利用結(jié)合位點(diǎn)的保守性進(jìn)行預(yù)測(cè),對(duì)于大部分保守的結(jié)合位點(diǎn)而言其準(zhǔn)確性較好冗美,然而...
TME(Tumor Microenvironment)這邊打錯(cuò)了
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)筆記-2-文獻(xiàn)理解劉小澤寫(xiě)于19.6.11-文獻(xiàn)理解 筆記目的:根據(jù)生信技能樹(shù)的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組課程探索smart-seq2技術(shù)相關(guān)的分析技術(shù)課程鏈接在:http://jm.grazy.cn/in...