你是否兩個IntegerMatrix都改成了NumericMatrix
R稀疏矩陣轉(zhuǎn)化稠密矩陣|使用as.matrix()報錯:Cholmod error 'problem too large'在進行一些數(shù)據(jù)分析是經(jīng)常會需要將一個數(shù)據(jù)對象轉(zhuǎn)化為矩陣露久,以及稀疏矩陣(sparse matrix)和稠密矩陣之間的互化邑蒋。 問題&報錯 在R環(huán)境中,用的非常普遍的函數(shù)就是as....
你是否兩個IntegerMatrix都改成了NumericMatrix
R稀疏矩陣轉(zhuǎn)化稠密矩陣|使用as.matrix()報錯:Cholmod error 'problem too large'在進行一些數(shù)據(jù)分析是經(jīng)常會需要將一個數(shù)據(jù)對象轉(zhuǎn)化為矩陣露久,以及稀疏矩陣(sparse matrix)和稠密矩陣之間的互化邑蒋。 問題&報錯 在R環(huán)境中,用的非常普遍的函數(shù)就是as....
date: 2017.10.18author: Jinwen 前言 大家都在詬病DAVID而推薦R包clusterProfiler症汹,所以我也跟風…… clusterProfi...
你可以用seurat包Read10X()讀一下barcodes.tsv惶凝、genes.tsv、matrix.mtx犬钢,轉(zhuǎn)化成seurat對象再按照樓主方式轉(zhuǎn)化
如何將Seurat3.0版本的object轉(zhuǎn)換為monocle的CDS之前Monocle2直接輸入Seurat object只適用于Seuratv2.0版本的Seurat object苍鲜。官方也在github上的issue處表明暫時還未有直接將S...
作者,在rds轉(zhuǎn)化成loom中的barcode晴股,你這兒指的是啥呀愿伴?
R語言與python語言讀寫loom文件最近越來越多的分析需要用到loom文件,其中主要是python的數(shù)據(jù)分析以及RNA速率分析的時候电湘,格式之間的轉(zhuǎn)化需要我們分析一下隔节,這里分享給大家R及python對于loom文...
一個人什么時候會突然想談戀愛呢妹沙? 人生中遇到的每個人偶洋,出場順序真的很重要,很多人如果換一個時間認識距糖,就會有不同的結(jié)局玄窝。或許悍引,有些愛恩脂,只能止于唇齒,掩于歲月趣斤。 一個人什么時候會...
ChIP-seq數(shù)據(jù)分析實戰(zhàn)訓(xùn)練(一) 一俩块、安裝軟件(conda) 二、下載數(shù)據(jù) 參考文獻 Brookes, E. et al. Polycomb associates ge...
Markdown快速入門(一) 1、Markdown的編輯器 2镊逝、代碼塊 3壮啊、shell腳本 4、標題 一級標題 二級標題 三級標題 四級標題 五級標題 六級標題 5撑蒜、字體 ...