0.參考文獻:B?ckhed, F., Roswall, J., Peng, Y., Feng, Q., Jia, H., Kovatcheva-Datchary, P., ...
0.參考文獻:B?ckhed, F., Roswall, J., Peng, Y., Feng, Q., Jia, H., Kovatcheva-Datchary, P., ...
簡寫 RPKM: Reads Per Kilobase of exon model per Million mapped reads (每千個堿基的轉(zhuǎn)錄每百萬映射讀取的rea...
寫在前面 在進行染色體掛載之前一般對得到的 "primary assembly"(主要組裝/初始組裝結(jié)果)進行進一步的優(yōu)化,以減少錯誤梭纹,提高基因組的質(zhì)量和準(zhǔn)確性躲惰。然后再將這些...
drep可對基因組集去冗余,留下非冗余基因組集变抽。從運行過程來看础拨,先進行基因預(yù)測氮块,然后用chekm做基因組質(zhì)控,也因此需要安裝配置checkm诡宗,去冗余基于ANI有關(guān)的參數(shù)滔蝉。 文...
1.簡介: (1)介紹:MCScanX[http://chibba.pgml.uga.edu/mcscan2/#tm]采用改進了的MCScan算法蝠引,分析基因組內(nèi)或者基因組間的...
軟件安裝 軟件地址在http://www.compgen.uni-muenster.de/tools/teclass/index.hbi?, 由于TEclass這個軟件已經(jīng)許...