LD概念 連鎖不平衡(linkage disequilibrium, LD)也叫等位基因關聯(lián)，是指不同座位的兩個等位基因出現(xiàn)在一條染色體上的頻率與隨機組合出現(xiàn)的頻率不一致的情...
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重測序分析（12）群體進化分析之LD衰減分析 -
學生信為什么要學Linux常見的操作系統(tǒng) Windows Mac OS (distant cousin to Linux) Android iOS Linux OS (Linux kernel + G...
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重測序分析（13）群體進化分析之群體選擇分析
進化論 - 達爾文進化論 生物物種存在廣泛變異 自然選擇，適者生存和繁殖麻车，不適者淘汰 生命是單起源的 - 中性學說 大多數(shù)突變是“中性”的 進化主要是中性突變進行隨機的遺傳漂...
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連雨不知春去抵蚊，一晴方覺夏深
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群體遺傳學必備知識錦囊群體遺傳學應知應會 今天分享一篇關于群體遺傳學的筆記辩棒，主要參考了網(wǎng)絡公開資料以及公開發(fā)表的文獻，包含群體遺傳的概述膨疏、研究方法一睁、應用領域、分析流程佃却、統(tǒng)計學原理者吁、群體結(jié)構評估等。...
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群體進化分析--基因流及群體歷史分析——我愿稱之為史上最全基因流（也稱基因遷移）是指從一個物種的一個種群向另一個種群引入新的遺傳物質(zhì)，從而改變?nèi)后w“基因庫”的組成赦邻。通過基因交流向群體中引入新的等位基因髓棋，是遺傳變異一個非常重要的來源，...
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2023-03-21 | Dsuite做D及f4-ratio統(tǒng)計量Dsuite原理： D值（即ABBA統(tǒng)計量）和f4-ratio統(tǒng)計可以表示為適用于四個分類群的雙等位基因SNP：P1,P2,P3,O，拓撲是 (((P1,P2),P3),O)...
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群體遺傳學與重測序分析分子層面對生物的研究镣奋，在個體水平上主要是看單個基因的變化以及全轉(zhuǎn)錄本的變化（RNA-seq）；在對個體的研究的基礎上怀愧，開始了群體水平的研究侨颈。如果說常規(guī)的遺傳學主要的研究對象是...
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遺傳統(tǒng)計|Tajima D, Watterson θw和π的計算
在描述基因組受選擇情況時哈垢，通常會采取一些指標來衡量其在演化過程中受到何種自然選擇。在這其中Tajima D是常見的衡量物種自然選擇的指標扛拨。Tajima’s D是由日本研究員田...
