轉(zhuǎn)自iProteome记劝，略有修改圆雁，作者：項(xiàng)杭敛惊，翻譯自2018年 CELL文章The Human Transcription Factors奕塑， 授權(quán)轉(zhuǎn)載柬赐。ScienceDire...
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搬磚的工人<br>
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《自私的基因》 讀書筆記創(chuàng)造人工智能的人類又是一個(gè)怎樣的存在呢袖裕？人類又是如何在時(shí)間的長河中塑造為今天的模樣的呢曹抬？ 英國皇家學(xué)會(huì)會(huì)士理查德·道金斯的《自私的基因》將提出一個(gè)極具爭議的話題：人生來自私，...
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基因編輯如何換藥不換湯
To destroy is easier than to create急鳄，摧毀總比創(chuàng)造要簡單谤民，這句話轉(zhuǎn)換到基因編輯上就是：knockout比knock in容易。因?yàn)閗nock...
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Cre-LoxP條件性基因編輯系統(tǒng)--學(xué)習(xí)筆記背景 Cre/LoxP系統(tǒng)來源于F1噬菌體疾宏，是非常經(jīng)典有效的基因編輯技術(shù)张足。 1. 什么是Cre Cre重組酶(cyclizationrecombination)，它是一種由3...
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第七章 拉馬克和他的獲得性遺傳
達(dá)爾文主義者的眼里，基因的變化是隨機(jī)性的岩馍，人后天的行為不會(huì)通過基因傳遞給后代碉咆。這就是說，人的后天努力和改變沒有生物學(xué)上的意義蛀恩。 然而疫铜，另一種進(jìn)化學(xué)說認(rèn)為生物后天的...
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GTF/GFF文件的差異及其相互轉(zhuǎn)換我們在做生物分析的時(shí)候壳咕，經(jīng)常會(huì)碰到GFF格式的文件以及GTF格式的注釋文件席揽。他們有著相似的名字，甚至連內(nèi)容都極為相似~那么谓厘，他們究竟差在哪里呢幌羞？ GFF全稱為general ...
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轉(zhuǎn)變Genotype數(shù)據(jù)格式（Hapmap惜论，Plink 许赃，VCF ，Haplotype馆类， Numeric 混聊， BLUPF90 格式的相互轉(zhuǎn)化）主要使用blupADC[https://qsmei.netlify.app/zh/post/2021-04-21-r-package-rblupadc-overview/ov...
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下載dbGap數(shù)據(jù)第一次下載，記錄一下乾巧。歡迎小伙伴提提建議句喜，有什么更好更快的下載方式和操作 https://mubu.com/doc/a8VEr7Tfb0 找的時(shí)候居然忘記之前寫過記錄。沟于。咳胃。??...
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bed文件轉(zhuǎn)成等bin的bedgraph格式目的： 當(dāng)你想可視化你所研究的數(shù)據(jù)在染色體上分布，可能會(huì)用到RIdeogram來畫類似的圖旷太。如何整理成要求的輸入文件格式呢展懈？ 標(biāo)準(zhǔn)輸入文件： 一定長度為bins 的count...
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遠(yuǎn)程控制及投屏工具（PC/android）筆記本遠(yuǎn)程控制工具 向日葵個(gè)人免費(fèi)版(300kb/s)image.png Todesk(目前內(nèi)測中，沒有網(wǎng)速限制) 推薦image.png Teamviewer(易檢測商用)...
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GATK下游VCF maf可視化
VCF可以通過不同的上游分析獲得供璧，在格式上又有一些不同存崖，盲目轉(zhuǎn)化會(huì)帶來很多問題。查看VCF文件內(nèi)容可知是通過GATK上游處理得到的睡毒。 為了對(duì)變異結(jié)果進(jìn)一步進(jìn)行可視化分析来惧，查找...
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BLAST結(jié)果可視化老板就是上帝 上帝說要有光，于是就有了光 導(dǎo)師說要有可視化結(jié)果吕嘀，于是我努力把結(jié)果可視化~ 前情提示 為了知道測序reads中污染物的來源违寞，我們之前學(xué)習(xí)使用了blast贞瞒，甚至為...
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2020-06-29 GTAK4 從小白到跑通一個(gè)best practice pipeline—— 從一無所知到前期工作準(zhǔn)備妥當(dāng)?shù)恼麄€(gè)學(xué)習(xí)路徑，涉及到多篇文檔趁曼，算是一篇流水賬(在gatk4網(wǎng)站的文檔海洋中漫游真的會(huì)被嗆死...) 前言：最開始當(dāng)然是想越快跑起來越好军浆，跳...
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2020-01-13 序列比對(duì)（一）：入門序列比對(duì)定義 序列比對(duì)（特別是pairwise alignment）是指以某種方式排列兩個(gè)序列乒融，對(duì)齊具有相似性的區(qū)域。 例如GATTACA和GATCA的對(duì)齊（注意這兩個(gè)序列長...
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【W(wǎng)indows】 Dos編程入門背景: 目前windows電腦很少有人學(xué)習(xí)dos 語法了摄悯，一般可以下載一個(gè)git 工具赞季，這樣可以使用linux命令操作本地文件了； 如下圖： 日常我們大都使用Windows ...
