根據(jù)浙科版高中生物學(xué)選修一38頁(yè)淀粉水解流程圖的描述，很容易讓人誤以為三者的作用底物分別為淀粉躁染、糊精和麥芽糖埠偿，為了便于理解幾類(lèi)淀粉酶的作用餐抢，先需要辨析兩組概念：直鏈淀粉與支鏈...
發(fā)簡(jiǎn)信
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α-淀粉酶、β-淀粉酶和糖化淀粉酶的區(qū)別
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草食性和肉食性動(dòng)物的消化系統(tǒng)差異
今天我來(lái)分析一下草食性和肉食性動(dòng)物的消化系統(tǒng)差異 第一是牙 肉食動(dòng)物一般都有特別長(zhǎng)的牙齒枫绅，這是為什么呢指黎？我猜測(cè)可能是因?yàn)槿笛矗氖澄飦?lái)源導(dǎo)致它的牙齒...
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廣義線性模型一（Generalized Linear Models蒲赂，GLM）參考從線性模型到廣義線性模型（1）——模型假設(shè)篇 | 統(tǒng)計(jì)之都 (cosx.org)[https://cosx.org/2011/01/how-does-glm-genera...
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廣義線性混合模型（GLMM）
知識(shí)背景 廣義線性混合模型可以看做是廣義線性模型（GLM）以及線性混合模型(LMM)的擴(kuò)展，為了更好地理解GLMM刁憋，肯定要對(duì)普通線性模型滥嘴、廣義線性模型以及線性混合模型有個(gè)理解...
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R語(yǔ)言的排序函數(shù)(order, sort, rank)及匹配函數(shù)（match,%in%)用法詳解
一，排序函數(shù) R語(yǔ)言中职祷，和排序相關(guān)的常用函數(shù)有：order()协屡，sort()，rank()婴噩，一般是對(duì)向量進(jìn)行操作醉箕，也可以對(duì)數(shù)據(jù)框的列進(jìn)行操作。1. order(..., de...
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R 函數(shù)筆記 | grep()函數(shù)與R語(yǔ)言中的正則表達(dá)式
grep()能對(duì)向量中特定條件的元素進(jìn)行查詢泥耀，默認(rèn)return為index饺汹。grep()語(yǔ)法與grep()大致相似，但默認(rèn)return為logical痰催。 grep() 代碼如...
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R數(shù)據(jù)分析：嵌套數(shù)據(jù)分析為什么要用加隨機(jī)效應(yīng)兜辞？終于解釋清楚了
自己已經(jīng)寫(xiě)了好幾篇關(guān)于隨機(jī)效應(yīng)模型的文章了迎瞧，今天換個(gè)角度，從傳統(tǒng)回歸和隨機(jī)效應(yīng)模型的對(duì)比中模擬出兩模型真正的差異逸吵，讓你明白加上隨機(jī)效應(yīng)到底對(duì)模型會(huì)有什么樣的改變凶硅。 回顧 在傳...
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R數(shù)據(jù)分析：混合效應(yīng)模型的可視化解釋?zhuān)俨欢驼鏇](méi)辦法
好多同學(xué)咨詢我混合效應(yīng)模型首量，有些問(wèn)題自己需要講很多遍，想想就再開(kāi)一貼进苍，爭(zhēng)取這一篇文章給大家寫(xiě)清楚加缘。 混合效應(yīng)模型名字很多，Hierarchical Modeling, als...
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R | 簡(jiǎn)單的學(xué)生檢驗(yàn)（t-test）
Student's test —— 簡(jiǎn)稱(chēng)t-test琅捏，據(jù)說(shuō)是作者當(dāng)年為避風(fēng)頭而用‘’學(xué)生”這一筆名生百，所以就將該種方法稱(chēng)為學(xué)生檢驗(yàn)了。百度百科：t-test 主要用于樣本含量較...
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R語(yǔ)言中的管道%>%
本文首發(fā)于我的個(gè)人博客[https://www.ikeguang.com/?p=1783] ％>％來(lái)自dplyr包的管道函數(shù)柄延，我們可以將其理解為車(chē)間里的流水線蚀浆，經(jīng)過(guò)前一步加工...
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PLS-DA代替PCA試試降維效果？最近有小伙伴問(wèn)道PLS-DA（Partial least squares Discriminant Analysis搜吧，偏最小二乘判別分析）市俊，一種組學(xué)分析中常用的多變量分析方法...
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R語(yǔ)言可視化（十六）：PCA圖繪制16. PCA圖繪制 清除當(dāng)前環(huán)境中的變量 設(shè)置工作目錄 加載示例數(shù)據(jù) 使用prcomp函數(shù)進(jìn)行PCA分析 使用基礎(chǔ)plot函數(shù)繪制PCA圖 使用ggplot2包繪制PCA圖...
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用PLS和OPLS分析代謝組數(shù)據(jù)簡(jiǎn)介例1. 不同品種代謝產(chǎn)物OPLS-DA loading plot1 安裝2 內(nèi)置數(shù)據(jù)介紹 代謝物對(duì)個(gè)體性別的定性響應(yīng) - PLS執(zhí)行PLS-DA結(jié)果參數(shù)解釋模型評(píng)估常用可...
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方差分析（ANOVA)原理及其實(shí)現(xiàn)
諸如t-test, one-way anova, two-way anova等統(tǒng)計(jì)學(xué)差異顯著性分析在生物實(shí)驗(yàn)中非常常見(jiàn)。這些分析手段的計(jì)算公式對(duì)于搞生物的人來(lái)說(shuō)還是比較復(fù)雜的...
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差異分析工具STAMP手冊(cè)2:使用手冊(cè)（漢版）出于時(shí)代的自覺(jué)滤奈，我主動(dòng)承擔(dān)了STAMP(Statistical Analysis of Metagenomic Profiles)使用文檔的翻譯工作摆昧。原文28頁(yè)，翻譯如下蜒程，歡...
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宏基因組功能注釋?zhuān)ㄒ訡OG為例）Contigs/Scaffolds序列經(jīng)基因預(yù)測(cè)绅你、ORF開(kāi)放閱讀框識(shí)別（Open Reading fr ame）和蛋白翻譯之后，就可以進(jìn)行功能注釋分析了昭躺。我們將基因/蛋白序列...
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宏基因組 - (4)使用dbCAN2對(duì)非冗余基因集進(jìn)行CaZy注釋(待更新-1.僅作筆記使用 我所用到的所有腳本可以+Q 840842906索 簡(jiǎn)單介紹一下方向也可以忌锯，說(shuō)不定以后能互相幫忙～ 0. 功能注釋這一塊大體上就是用自己的序列去和各種數(shù)據(jù)庫(kù)...
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KEGG pathway 注釋整理
KEGG pathway 注釋整理 獲得KEGG注釋 通過(guò)eggnog-mapper和interproscan兩個(gè)軟件(或數(shù)據(jù)庫(kù))，可以獲得KEGG ORTHOLOGY(KO...
