根據(jù)浙科版高中生物學(xué)選修一38頁淀粉水解流程圖的描述货岭，很容易讓人誤以為三者的作用底物分別為淀粉斗埂、糊精和麥芽糖曼月，為了便于理解幾類淀粉酶的作用，先需要辨析兩組概念：直鏈淀粉與支鏈...
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α-淀粉酶橙数、β-淀粉酶和糖化淀粉酶的區(qū)別
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草食性和肉食性動物的消化系統(tǒng)差異
今天我來分析一下草食性和肉食性動物的消化系統(tǒng)差異 第一是牙 肉食動物一般都有特別長的牙齒，這是為什么呢？我猜測可能是因為跪楞，它的食物來源導(dǎo)致它的牙齒...
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廣義線性模型一（Generalized Linear Models，GLM）參考從線性模型到廣義線性模型（1）——模型假設(shè)篇 | 統(tǒng)計之都 (cosx.org)[https://cosx.org/2011/01/how-does-glm-genera...
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廣義線性混合模型（GLMM）
知識背景 廣義線性混合模型可以看做是廣義線性模型（GLM）以及線性混合模型(LMM)的擴展侣灶，為了更好地理解GLMM甸祭，肯定要對普通線性模型、廣義線性模型以及線性混合模型有個理解...
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R語言的排序函數(shù)(order, sort, rank)及匹配函數(shù)（match,%in%)用法詳解
一褥影，排序函數(shù) R語言中池户，和排序相關(guān)的常用函數(shù)有：order()，sort()凡怎，rank()校焦，一般是對向量進行操作，也可以對數(shù)據(jù)框的列進行操作栅贴。1. order(..., de...
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R 函數(shù)筆記 | grep()函數(shù)與R語言中的正則表達式
grep()能對向量中特定條件的元素進行查詢斟湃，默認return為index。grep()語法與grep()大致相似檐薯，但默認return為logical。 grep() 代碼如...
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R數(shù)據(jù)分析：嵌套數(shù)據(jù)分析為什么要用加隨機效應(yīng)？終于解釋清楚了
自己已經(jīng)寫了好幾篇關(guān)于隨機效應(yīng)模型的文章了坛缕，今天換個角度墓猎，從傳統(tǒng)回歸和隨機效應(yīng)模型的對比中模擬出兩模型真正的差異，讓你明白加上隨機效應(yīng)到底對模型會有什么樣的改變赚楚。 回顧 在傳...
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R數(shù)據(jù)分析：混合效應(yīng)模型的可視化解釋俭嘁，再不懂就真沒辦法
好多同學(xué)咨詢我混合效應(yīng)模型躺枕，有些問題自己需要講很多遍，想想就再開一貼供填，爭取這一篇文章給大家寫清楚拐云。 混合效應(yīng)模型名字很多，Hierarchical Modeling, als...
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R | 簡單的學(xué)生檢驗（t-test）
Student's test —— 簡稱t-test近她，據(jù)說是作者當(dāng)年為避風(fēng)頭而用‘’學(xué)生”這一筆名叉瘩，所以就將該種方法稱為學(xué)生檢驗了。百度百科：t-test 主要用于樣本含量較...
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R語言中的管道%>%
本文首發(fā)于我的個人博客[https://www.ikeguang.com/?p=1783] ％>％來自dplyr包的管道函數(shù)粘捎，我們可以將其理解為車間里的流水線薇缅，經(jīng)過前一步加工...
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PLS-DA代替PCA試試降維效果？最近有小伙伴問道PLS-DA（Partial least squares Discriminant Analysis晌端，偏最小二乘判別分析）捅暴，一種組學(xué)分析中常用的多變量分析方法...
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R語言可視化（十六）：PCA圖繪制16. PCA圖繪制 清除當(dāng)前環(huán)境中的變量 設(shè)置工作目錄 加載示例數(shù)據(jù) 使用prcomp函數(shù)進行PCA分析 使用基礎(chǔ)plot函數(shù)繪制PCA圖 使用ggplot2包繪制PCA圖...
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用PLS和OPLS分析代謝組數(shù)據(jù)簡介例1. 不同品種代謝產(chǎn)物OPLS-DA loading plot1 安裝2 內(nèi)置數(shù)據(jù)介紹 代謝物對個體性別的定性響應(yīng) - PLS執(zhí)行PLS-DA結(jié)果參數(shù)解釋模型評估常用可...
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方差分析（ANOVA)原理及其實現(xiàn)
諸如t-test, one-way anova, two-way anova等統(tǒng)計學(xué)差異顯著性分析在生物實驗中非常常見。這些分析手段的計算公式對于搞生物的人來說還是比較復(fù)雜的...
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差異分析工具STAMP手冊2:使用手冊（漢版）出于時代的自覺咧纠，我主動承擔(dān)了STAMP(Statistical Analysis of Metagenomic Profiles)使用文檔的翻譯工作蓬痒。原文28頁，翻譯如下漆羔，歡...
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宏基因組功能注釋（以COG為例）Contigs/Scaffolds序列經(jīng)基因預(yù)測梧奢、ORF開放閱讀框識別（Open Reading fr ame）和蛋白翻譯之后，就可以進行功能注釋分析了演痒。我們將基因/蛋白序列...
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宏基因組 - (4)使用dbCAN2對非冗余基因集進行CaZy注釋(待更新-1.僅作筆記使用 我所用到的所有腳本可以+Q 840842906索 簡單介紹一下方向也可以亲轨，說不定以后能互相幫忙～ 0. 功能注釋這一塊大體上就是用自己的序列去和各種數(shù)據(jù)庫...
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KEGG pathway 注釋整理
KEGG pathway 注釋整理 獲得KEGG注釋 通過eggnog-mapper和interproscan兩個軟件(或數(shù)據(jù)庫)，可以獲得KEGG ORTHOLOGY(KO...
