orthofinde作者 推薦可以自己處理焰坪,提取最長的轉(zhuǎn)錄本
「基因組學(xué)」使用OrthoFinder進(jìn)行直系同源基因分析談?wù)摰街毕低椿蚍治龅臅r(shí)候,大部分教程都是介紹OrthoMCL聘惦,這是2003年發(fā)表的一個(gè)工具某饰,目前的引用次數(shù)已經(jīng)達(dá)到了3000多儒恋,但這個(gè)軟件似乎在2013年之后就不在更新,...
你好, 我想問一下鳍置,我用A個(gè)體的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)可以注釋我的B個(gè)體基因組嗎辽剧?它們是同一個(gè)種, 我自己的沒有測轉(zhuǎn)錄組税产,因?yàn)槲乙呀?jīng)用了A個(gè)體大蛋白集怕轿,應(yīng)該不用轉(zhuǎn)錄組了吧?還是說轉(zhuǎn)錄組可以幫我注釋5‘-UTR 和3’-UTR嗎辟拷, 謝謝
使用MAKER進(jìn)行基因注釋(高級篇之AUGUSTUS模型訓(xùn)練)準(zhǔn)備訓(xùn)練集和測試集 根據(jù)Augutus的官方教程撞羽,可靠的基因結(jié)構(gòu)序列的要求如下: 提供基因的編碼部分,包含上游幾KB衫冻。通常而言诀紊,基因越多,效果越好羽杰,至少準(zhǔn)備200個(gè)基因以上渡紫。...