0. 簡介 這篇文章是來自于明尼蘇達(dá)大學(xué)的Chad L. Myers在The Plant Cell發(fā)表的關(guān)于整合共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)與GWAS來挖掘玉米中的causal genes.文...
IP屬地：臺灣
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Integrating Coexpression Networks with GWAS to Prioritize Causal Genes in Maize -
細(xì)胞類型鑒定--單細(xì)胞marker基因（持續(xù)修正）細(xì)胞類型marker基因T CellsCD3D, CD3EThCD3D, CD3E, CD40LGTcCD3D, CD3E, CD8A, CD8BgdTTRDV2, TRGV...
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基因芯片 尋找探針?biāo)鶎?yīng)的基因ID最近在學(xué)習(xí)處理芯片數(shù)據(jù)零院，遇到一個問題就是芯片數(shù)據(jù)和基因ID之間的對應(yīng)問題宋距。不然感覺自己做出的東西沒有辦法分析翠胰。 先來看一下芯片探針與基因直接的關(guān)系： ·探針組與基因關(guān)系：...
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單細(xì)胞分辨率下腎細(xì)胞癌和微環(huán)境的多區(qū)域表征[10X單細(xì)胞聯(lián)合10XVDJ分析、Mutation Calling]hello恬总，大家好凡资，我們的分析也慢慢進(jìn)入深水區(qū)了籍胯，很多方法需要聯(lián)合起來使用幽七，如何靈活運(yùn)用各種方法，就需要我們的經(jīng)驗(yàn)和智慧了溅呢。今天分享的文獻(xiàn)在Multi-regional ch...
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熱圖2：分組聚類澡屡，讓熱圖分裂還記得之前我們發(fā)過的熱圖嗎？ 樣品之間聚類的時候發(fā)現(xiàn)對照和實(shí)驗(yàn)組混合到了一起咐旧。這是由于樣品一致性差造成的驶鹉，這種情況很多時候都會遇到。一般的做法是放棄列的聚類铣墨。但是我不室埋，很多文...
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ComplexHeatmap熱圖繪制 | 指定基因在熱圖中標(biāo)記如想獲得圖例代碼和數(shù)據(jù)，請到公眾號“小杜的生信筆記”中回復(fù)“20220117”伊约，鏈接有效期2022.17-2022.2.17（特別申明：該數(shù)據(jù)僅是演示數(shù)據(jù)姚淆，無任何意義） 教程...
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10X單細(xì)胞空間聯(lián)合表征腎細(xì)胞癌與其微環(huán)境周五了，一周的收官之戰(zhàn)屡律，我們繼續(xù)分享單細(xì)胞空間聯(lián)合分析的內(nèi)容腌逢，這一篇我們參考的文章在Multi-regional characterisation of renal cell...
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不好好做圖的NSC系列(七):跟著cell學(xué)習(xí)用散點(diǎn)圖展示韋恩圖的效果
好久不見！ 今天我們重復(fù)和學(xué)習(xí)這篇cell文章的Figure 3D超埋。仔細(xì)看圖搏讶，這個散點(diǎn)圖表示的是兩種細(xì)胞中上調(diào)的基因，很明顯散點(diǎn)作圖用的是基因Log2FC做的霍殴。再仔細(xì)看看媒惕，這...
