華中農(nóng)業(yè)大學(xué)<br>園藝植物生物學(xué)教育部重點(diǎn)實驗室
IP屬地：湖北
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基因家族擴(kuò)張或收縮（未完待續(xù)）基因家族擴(kuò)張或收縮，進(jìn)化樹1[http://www.reibang.com/p/8c6ef557cc71?from=singlemessage] 2[https://ww...
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SCAU課堂 | 「比較基因組分析」專用 Docker 鏡像寫在前面 沒想到，上個選修課历筝，準(zhǔn)備示例數(shù)據(jù)和鏡像上，竟然花了我三四天....主要原因還是梳猪，「網(wǎng)速太差」蒸痹。搞七搞八春弥，終于搞定匿沛。盡管整完之后扫责，我其實擔(dān)心學(xué)生拿到這個使用文檔也不知...
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enrichplot||基因富集結(jié)果可視化解決方案enrichplot包實現(xiàn)了幾種可視化方法來幫助解釋富集結(jié)果。它支持從DOSE (Yu et al. 2015)抡笼、clusterProfiler (Yu et al. 201...
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周運(yùn)來吐葱，男校翔，長大了才會遇到的帥哥，穩(wěn)健防症，瀟灑，大方蔫敲，靠譜。一段生信緣奈嘿，一棵技能樹。生信技能樹核心成員裙犹，單細(xì)胞天地供稿人尽狠，簡書創(chuàng)作者叶圃，單細(xì)胞數(shù)據(jù)科學(xué)家掺冠。
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BLAST數(shù)據(jù)庫構(gòu)建過程中sseqid無法關(guān)聯(lián)到staxids的問題blast本地數(shù)據(jù)庫構(gòu)建已經(jīng)是一個很繁瑣的事情了心赶，比對NT或NR數(shù)據(jù)庫還是會遇到各種問題：廢話少說缺猛，先記錄一下本地構(gòu)建BLAST數(shù)據(jù)庫： 下載安裝BLAST+的過程，并添加環(huán)...
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PASA（2.4.1）使用記錄
文章僅是記錄自己的學(xué)習(xí)使用箫攀，有錯誤請指出肠牲，我立刻改正！ 官方說明：https://github.com/PASApipeline/PASApipeline/wiki[http...
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如何對基因組序列進(jìn)行注釋基因組組裝完成后扬绪，或者是完成了草圖挤牛，就不可避免遇到一個問題莹痢，需要對基因組序列進(jìn)行注釋。注釋之前首先得構(gòu)建基因模型，有三種策略： 從頭注釋(de novo prediction...
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「生信」基因組功能注釋后的基因篩選目錄寫在前面功能注釋數(shù)據(jù)庫介紹方法一: 以KEGG的注釋結(jié)果為主, 篩選出每個品種包含的特異通路及基因方法二: 利用pfam的注釋結(jié)果, 過濾掉每個品種具有相同結(jié)構(gòu)域的基因,...
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宏基因組功能注釋（以COG為例）Contigs/Scaffolds序列經(jīng)基因預(yù)測梁厉、ORF開放閱讀框識別（Open Reading fr ame）和蛋白翻譯之后辜羊，就可以進(jìn)行功能注釋分析了八秃。我們將基因/蛋白序列...
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