學(xué)習(xí)來的別亂看

相關(guān)性分析 相關(guān)性分析是指對兩個或多個具備相關(guān)性的變量元素進(jìn)行分析彭沼，從而衡量兩個變量因素的相關(guān)密切程度隅居。相關(guān)性分析旨在研究兩個或兩個以上隨機(jī)變量之間相互依存關(guān)系的方向和密切程...

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熱圖可以聚合大量的數(shù)據(jù)屿脐，并可以用一種漸進(jìn)色來優(yōu)雅地表現(xiàn)涕蚤，可以很直觀地展現(xiàn)數(shù)據(jù)的疏密程度或頻率高低宪卿。 本文利用R語言pheatmap包從頭開始繪制各種漂亮的熱圖。參數(shù)像積木万栅，拼...

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Emmm, 今天的主圖佑钾， 寫在前面 博士畢業(yè)論文中，使用的樣品包括： 不同的類型 / 或者說不同的組織 不同的時間 / 或者說時間序列所以烦粒，是一個多X多的設(shè)計休溶。對于這類實驗設(shè)...

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TaoYan 簡介 本文將繪制靜態(tài)與交互式熱圖，需要使用到以下R包和函數(shù)：heatmap():用于繪制簡單熱圖的函數(shù)heatmap.2():繪制增強(qiáng)熱圖的函數(shù)d3heatma...

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"Beautiful Visualization with R" provides a comprehensive introduction to the many type...

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火山圖是散點圖的一種扰她，它將統(tǒng)計測試中的統(tǒng)計顯著性量度（如p value）和變化幅度相結(jié)合兽掰，從而能夠幫助快速直觀地識別那些變化幅度較大且具有統(tǒng)計學(xué)意義的數(shù)據(jù)點（基因等）。常應(yīng)用...

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10xGenomics單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄seurat包提取表達(dá)量畫小提琴圖 需求提取表達(dá)畫小提琴圖對噪音處理 需求 其實seurat包已經(jīng)有畫小提琴圖的函數(shù)徒役，VlnPlot孽尽，參數(shù)也較...

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單細(xì)胞之Seurat包實戰(zhàn) 我們演示的數(shù)據(jù)集是E-MTAB-7704,可以從github中下載。 1. 特征描述 2. PCA主成分分析 PCA分析 繪制每個PCA成分的相關(guān)...

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什么是KEGG KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)是系統(tǒng)分析基因功能、基因組信息數(shù)據(jù)庫贡羔，它有助于研究者把基因及表達(dá)信息...

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在線工具一般具有“功能強(qiáng)大乖寒、操作簡單猴蹂、無需安裝、用完就走”的特點楣嘁，輕松實現(xiàn)“用別人的服務(wù)器分析自己的數(shù)據(jù)”磅轻。 基因結(jié)構(gòu)繪制 1.Exon-Intron Graphic Mak...

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MSEA 什么是MSEA MSEA，Metabolite Set Enrichment Analysis逐虚，代謝集富集分析聋溜，是代謝組數(shù)據(jù)分析方法的一種。MSEA是基因集富集分析...