import pandasas pd import numpyas np import os import csv import rdkit from rdkitimport...
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python處理csv文件
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RDKit是一種過時(shí)的還是?最近老師讓我用這個(gè)做虛曬，之前一直用薛定諤的
RDKit|化學(xué)特征、藥效團(tuán)提取與2D藥效團(tuán)指紋計(jì)算
一掌挚、化學(xué)特征和藥效團(tuán)提取 二钥庇、化學(xué)特征文件介紹1.化學(xué)特征（chemical features）2.FDef文件語法 三策吠、2D藥效團(tuán)指紋1.編碼原理2.參數(shù)設(shè)置3.生成2D藥...
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[16:28:06] Explicit valence for atom # 10 N, 4, is greater than permitted Traceback (most recent ...
Explicit valence for atom # 10 N, 4, is greater than permitted RDKIt讀取部分分子文件進(jìn)行操作時(shí)出現(xiàn)這種問題...
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2022-01-19 windows11 打開任務(wù)管理器發(fā)現(xiàn)占用內(nèi)存太高把windows資源管理器右擊重新啟動(dòng)层皱，一次不行多試幾次伴箩。就會(huì)降低占用率识椰，不過這種辦法好像不是永久的
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2022-01-18 使用RDKit計(jì)算分子相似性绝葡，并將相似性結(jié)果寫入excel文件，做分布圖
import xlwt import rdkit from rdkitimport Chem from rdkit.Chemimport Draw from rdkit.Ch...
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2022-01-10 利用RDKit基于分子指紋相似性對(duì)sdf小分子數(shù)據(jù)進(jìn)行篩選
import rdkit from rdkit import Chem from rdkit.Chem import Draw from rdkit.Chem import ...
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聚焦科研，關(guān)注智能种蘸，設(shè)計(jì)未來
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pycharm運(yùn)行代碼只顯示Process finished with exit code 0墓赴，路徑中沒有生成結(jié)果文件1 沒有可視化結(jié)果 可能是configuration的問題 這就需要進(jìn)行文件配置竞膳，在運(yùn)行當(dāng)前代碼時(shí)需要對(duì)當(dāng)前文件進(jìn)行配置，這里有兩種方法： 首先第一種就是快捷鍵（相對(duì)來說方...
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2022-01-04 windows7 cmd切換盤符
cmd切換到D盤的方法：首先按下鍵盤上的【win+r】鍵诫硕；然后輸入cmd并按回車坦辟；最后在cmd運(yùn)行窗口中輸入【d:】即可進(jìn)入D盤根目錄。
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D:\360Downloads\python\Scripts最后在python的scripts路徑下找到pymol.exe文件章办，拖到桌面即可锉走。
2022-01-04 pymol開源版的安裝教程
Pymol開源版的安裝， 首先需要下載python和pymol安裝包藕届，兩者版本需要對(duì)應(yīng)挪蹭，否則無法進(jìn)行下去， 鏈接https://pan.baidu.com/s/182ZVCq...
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2022-01-04 pymol開源版的安裝教程
Pymol開源版的安裝休偶， 首先需要下載python和pymol安裝包梁厉，兩者版本需要對(duì)應(yīng)，否則無法進(jìn)行下去踏兜， 鏈接https://pan.baidu.com/s/182ZVCq...
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2021-12-28
今天第一次想用簡(jiǎn)書記錄自己的學(xué)習(xí)生活词顾，希望給自己一些積極的反饋，讀研以來碱妆，學(xué)習(xí)狀況一直很不好肉盹，課題沒進(jìn)展。學(xué)習(xí)收獲甚微疹尾。多給自己一些正面的反饋是一件好事上忍，希望順利畢業(yè)，并且找...
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如果你是程序員，或者有一顆喜歡寫程序的心繁成，喜歡分享技術(shù)干貨它抱、項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)、程序員日常囧事等等朴艰，歡迎投稿《程序員》專題。 專題主編：小彤花園 http://www.reibang.com/users/4a4eb4feee62/ 【程序員】專題拒稿指北：http://www.reibang.com/p/7c8b33b5f63b 投稿須知： 1.收錄相關(guān)技術(shù)文章混移，但不限于技術(shù)祠墅，也可以是項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)類的文章和程序員日常。 2.文章內(nèi)不得有任何推廣信息歌径。包括但不限于公眾號(hào)毁嗦、微博、微信回铛，更不得在通過投稿后再修改文章加入推廣信息狗准。你可以將這些推廣以及個(gè)人信息放在個(gè)人主頁介紹里克锣。 3.字?jǐn)?shù)極少，段落混亂腔长，大段代碼沒有放到代碼框的文章不收錄 4.不相關(guān)的內(nèi)容不收錄袭祟，請(qǐng)確認(rèn)文章內(nèi)容和本專題相關(guān) 目前針對(duì)優(yōu)質(zhì)作者及愛好者，開設(shè)了官方程序員微信群捞附，希望加入請(qǐng)發(fā)簡(jiǎn)信給主編小彤花園索取個(gè)人微信巾乳，主編會(huì)將你加入到【程序員】微信群，分享內(nèi)容鸟召，收獲知識(shí)胆绊。添加微信時(shí)備注昵稱。
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故事專題，不論是旅行生活中親身經(jīng)歷的真實(shí)故事跟继，還是童話玄幻遐想的虛構(gòu)故事种冬，這里記錄你的每個(gè)故事。 歡迎向我們投稿你的故事还栓！ 所投稿件必須是一個(gè)完整的故事碌廓，故事包括但不限于：小說、世間故事剩盒、敘事散文谷婆、以敘事為主的回憶錄…… 投稿前，請(qǐng)閱讀最有趣的投稿指南： http://www.reibang.com/p/9da8500a57f0 投稿須知： 1.建議題材：有情節(jié)的小說辽聊、身邊的故事纪挎、敘事游記、以敘事為主的回憶錄跟匆、職業(yè)故事等异袄。 2.不建議題材：連載、只有大道理的雞湯玛臂、成功學(xué)烤蜕、工具文、詩歌迹冤、觀點(diǎn)時(shí)評(píng)類文章等讽营。 3.文章在一千字以上，排版合理泡徙，不影響閱讀體驗(yàn)橱鹏。 4.禁止外鏈宣傳。不得有個(gè)人微信、微信公眾號(hào)莉兰、微博挑围、豆瓣鏈接。 專題主編：似舞 http://www.reibang.com/u/021585ebd561 目前【故事】專題已建有專題社群糖荒，私信主編暗號(hào)“我愛故事”杉辙，即可獲得入群鏈接。任何投稿疑惑寂嘉，寫作問題奏瞬，感情困難，都可以進(jìn)群進(jìn)行申訴泉孩，會(huì)有專人解決你的問題硼端。
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VCF格式的學(xué)習(xí)及對(duì)VCF文件的統(tǒng)計(jì)
部分摘自# VincentLuo91的博客 Part 1 VCF格式的學(xué)習(xí) 1.什么是vcf句喷？VCF是用于描述SNP镣典，INDEL和SV結(jié)果的文本文件。在GATK軟件中得到最好...
