配色來源于論文 https://www.nature.com/articles/s41577-022-00707-2[https://www.nature.com/artic...
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R語言ggplot2作圖好看的配色備選 -
如何下載TCGA數(shù)據(jù)/TCGA數(shù)據(jù)下載小教程1. 什么是TCGA？TCGA中有哪些數(shù)據(jù)贷揽？ TCGA的全稱是The Cancer Genome Atlas, 這個項目始于2005年咸灿，它旨在使用基因測序和生物信息學(xué)編目與癌...
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3.2 GEO數(shù)據(jù)庫常用分析工具GEO數(shù)據(jù)庫常用分析工具 GEO DataSets提供的分析工具 GEO2R GEO DataSets提供的分析工具 在GEO DataSets的詳情界面有一個Data An...
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GEO數(shù)據(jù)庫dataset和profiles區(qū)別GEO Database 近年來雅镊，利用高通量方法檢測基因表達越來越普及众辨，諸如微陣列雜交和基因表系列分析（SAGE）可以同時測量數(shù)以萬計的基因轉(zhuǎn)錄腳本（gene transcr...
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數(shù)據(jù)挖掘?qū)W習(xí)---GEO 數(shù)據(jù)庫簡介GEO 數(shù)據(jù)是生信技能樹生信爆款入門課程[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzAxMDkxODM1Ng==&mid=2247497973&i...
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Cell：腦腫瘤免疫微環(huán)境圖譜 | 癌癥研究數(shù)據(jù)資源
來自瑞士洛桑大學(xué)的研究人員通過全面的多組學(xué)分析商佑，描述了腦腫瘤或膠質(zhì)瘤，以及從肺搔驼、乳房和皮膚轉(zhuǎn)移到大腦的腫瘤的免疫微環(huán)境圖譜谈火，為克服/支持腫瘤微環(huán)境（TME）特性以及利用TME...
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多芯片分析因為目前合并多個測序、芯片數(shù)據(jù)集這一塊并沒有完全統(tǒng)一的標準舌涨，方法大概有五六種糯耍。公說公有理婆說婆有理，對于我這樣的新手來說囊嘉，最簡單的是跟隨頂級文章的文章思路或者分析流程和步驟温技。...
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生信 | ATAC-Seq基礎(chǔ)分析+高級分析+多組學(xué)分析寫在前面 其實很多作者已經(jīng)探索的差不多了，相關(guān)腳本扭粱、教程也很多舵鳞，但我還是自己系統(tǒng)的總結(jié)一下吧。有時候感覺是浪費時間琢蛤，但是在寫的時候能發(fā)現(xiàn)并學(xué)習(xí)到很多新的知識蜓堕，不斷記錄反思，也...
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學(xué)習(xí)筆記之巨噬細胞亞型功能分析
1博其、巨噬細胞 巨噬細胞（Macrophage, M）是一類位于外周血套才，炎癥組織中的白細胞。在動物體內(nèi)主要通過吞噬細菌慕淡，死亡細胞及細胞殘片等作用參與非特異性免疫調(diào)節(jié)（先天性免疫...
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復(fù)現(xiàn)3：AD外周血的單細胞轉(zhuǎn)錄組與免疫組庫分析Single-Cell RNA Sequencing of Peripheral Blood Reveals Immune Cell Signatures in Alzhei...
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單細胞數(shù)據(jù)庫
signatureDB - B cell數(shù)據(jù)庫CancerSEA - 癌癥單細胞KIT（腎臟單細胞數(shù)據(jù)庫）：http://humphreyslab.com/SingleCel...
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轉(zhuǎn)錄組分析(1) - 基礎(chǔ)介紹轉(zhuǎn)錄組(transcriptome)背伴，廣義上指某一生理條件下，細胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的集合峰髓，包括信使RNA挂据、核糖體RNA、轉(zhuǎn)運RNA及非編碼RNA儿普；狹義上指所有mRNA的集合崎逃。轉(zhuǎn)...
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單基因的腫瘤細胞系表達怎么看？CCLE告訴你泛癌的基因表達量一般可以用TCGA和GTEx實現(xiàn)眉孩，但是腫瘤細胞系一般用CCLE臨床生信之家[https://www.aclbi.com/static/index.html#/...
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一文解決GEO芯片數(shù)據(jù)分析80％的工作个绍！建議收藏！
你不得不知道的GEO數(shù)據(jù)庫芯片數(shù)據(jù)分析方法 大家好浪汪，我是阿琛巴柿。今天來給大家介紹一個新的專題內(nèi)容---GEO數(shù)據(jù)庫的使用方法。烹飪需要食材死遭，分析需要數(shù)據(jù)广恢。數(shù)據(jù)出發(fā)，整個研究的第...
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低級膠質(zhì)瘤中EMILIN2的表達呀潭、甲基化和預(yù)后特征Wang LC, Cui WY, Zhang Z, Tan ZL, Lv QL, Chen SH, Shen XL. Expression, methylation and ...