生命數(shù)據(jù)科學

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人類miRNA名稱標準化數(shù)據(jù)庫
該數(shù)據(jù)庫致力于收集、整理和提供規(guī)范化的miRNA命名信息，為學術(shù)界提供方便快捷的查詢工具甘改。通過使用這個數(shù)據(jù)庫，研究者能夠迅速找到所需的miRNA...

0.4 258 0 1
還在為畢業(yè)論文參考文獻格式發(fā)愁嗎灭抑，來試試批量國標（GB7714）引文數(shù)據(jù)庫
好久不見十艾，最近一直沒更新，日更幻想破滅了腾节，不過還是很開心忘嫉，建庫成功了建庫背景：又逢一年畢業(yè)季荤牍，每次引文都要一篇一篇復制粘貼去Pub...

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Pubmed挖掘工具——提取數(shù)據(jù)庫
手敲一篇推文，昨天搭了個數(shù)據(jù)庫庆冕，主要用于存放和檢索PubMed中出現(xiàn)過的數(shù)據(jù)庫~ 地址： https://haoran-chen.shinyap...

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TCGA數(shù)據(jù)庫 | 臨床數(shù)據(jù)不僅僅只有clinical.tsv
其實經(jīng)常分析TCGA數(shù)據(jù)庫時會發(fā)現(xiàn)康吵，clinical.tsv中基本沒什么可用信息，大部分數(shù)據(jù)都是缺失的访递，那么晦嵌，如何獲取比較全面的臨床數(shù)據(jù)，有哪些...

0.2 5015 4 12
STRINGdb | 交互式可視化蛋白網(wǎng)絡(luò)互作
在STRING數(shù)據(jù)庫中提交基因拷姿，獲取PPI網(wǎng)絡(luò)是比較常規(guī)的操作惭载，包括下游使用cytoscape進行美化和hub網(wǎng)絡(luò)的提取，但過程還是比較麻煩响巢，本...

1.7 1521 0 5
GEOsampleDB——搞定大規(guī)模GEO檢索時的樣本篩選
在GEO檢索時描滔，總能見到一些奇怪命名的樣本，這或許與測序時的脫敏相關(guān)踪古，但這也給后續(xù)數(shù)據(jù)使用時的篩選帶來不便含长，本期主要介紹一個數(shù)據(jù)庫，能大大提高樣...

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生信小操作（一）
本系列主要定期集中記錄一些實用的生信操作 1. 第一列作為行名灾炭，構(gòu)建數(shù)值矩陣假如我剛讀取了一個表達譜矩陣gene_exp茎芋，第一列為基因名，其余...

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GO蜈出、KEGG田弥、GSVA、GSEA | 多種富集方法該如何選擇
我個人看法铡原，不一定對哈偷厦，首先，GSEA和GSVA不是一回事燕刻，不能放在一起說只泼。 GSVA主要是通過感興趣的基因集來劃分樣本，有樣本基因表達譜和一個...

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scRNA-seq | 隨機抽選500個細胞

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