BBio

歡迎關注同名公主號：BBio 流程包括單切片的基本分析、scRNA整合、多切片整合他膳。 參考：https://satijalab.org/seurat/articles/spa...

清竹飲酒

將空間位置信息和轉錄組分析相結合砂心，對于癌癥驾荣、免疫夺欲、腫瘤免疫相互作用谓罗，組織微環(huán)境媒至，神經(jīng)和發(fā)育等領域顶别，有著令人期待的應用前景。 而作為單細胞轉錄組必備R包Seurat,與時俱進拒啰，...

單細胞空間交響樂

今天我們來學習一下簡單的基礎知識驯绎，空間高變基因，之前呢谋旦，已經(jīng)分享過Seurat內(nèi)置的方法計算高變基因剩失，文章在10X空間轉錄組之基因的空間表達模式[https://www.ji...

生信云筆記

日常瞎掰 ??奇奇怪怪的事又發(fā)生了册着，真就應了那句話拴孤，不出意外的話，意外就會發(fā)生了甲捏。演熟。。??最近需要用clusterProfiler做KEGG富集司顿，然后就出現(xiàn)了意外芒粹，居然出現(xiàn)N...

生信start_site

這兩天“王院長”幫別人分析snv數(shù)據(jù)兄纺，順便給我推薦了一個R包：maftools。我看了一下官網(wǎng)化漆，感覺是個非常強大的R包估脆。那必須要學習起來~實際上網(wǎng)上已經(jīng)有很多教程了，但都是用...

汪大山

注意： non-coding包括intergenic + UTR + intronexon包括CDS + UTRupstream和downstream一般指基因上下游的2kb...

xuzhougeng

mclust(Model-based clustering) 能夠基于高斯有限混合模型進行聚類获三，分類以及密度估計(density estimation)旁蔼。對于具有各種協(xié)方差結...

芒果芭樂

通過查看基于表達豐度進行癌癥分子亞型聚類的文獻中相關的部分锨苏，并進行學習疙教，將相關方法應用于George的數(shù)據(jù)。 2020-European Urology-Identifica...

Hayley筆記

WGCNA全稱weighted gene co-expression network analysis伞租，即加權基因共表達網(wǎng)絡分析贞谓。它是一種分析多個樣本基因表達模式的分析方法，...