公號(hào)“生物育種數(shù)據(jù)分析”作者疏旨，歡迎關(guān)注！日常分析生物數(shù)據(jù)分析筆記玻蝌、經(jīng)驗(yàn)和小技巧。
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：北京
-
-
粳稻參考基因組ID轉(zhuǎn)換粳稻參考基因組日本晴主要常用的有兩個(gè)版本，分別為The Rice Annotation Project (RAP)（https://rapdb.dna.affrc.go.jp...
-
AlphaFold 3-PyMOL可視化1. 軟件安裝 AlphaFold 3分析網(wǎng)站(需要梯子和谷歌賬號(hào))：https://golgi.sandbox.google.com/about[https://golgi...
-
TBtools | 全基因組 - 基因密度統(tǒng)計(jì)冒窍，充實(shí)你的圖片摘要 兩張圖總結(jié)本文，以方便大家確定是否還有看下去的興趣 寫在前面 Emmm... 今天開放一個(gè)舊功能豺鼻，全基因組基因密度統(tǒng)計(jì)综液。雖然是早前就寫好的，但我一直沒(méi)開放儒飒，主要是考慮到...
-
TBtools：在染色體上定位指定的基因（一整套流程）位置1.首先在Ensemblefungi獲取該物種整個(gè)基因組的gff注釋文件（或gtf注釋文件谬莹，有誰(shuí)就下載誰(shuí)） 2.指定基因id的獲取 可以用表格形式打開gff文件，一般指定基因...
-
學(xué)習(xí)小組Day7 筆記-測(cè)序原理及分類（徐擎昱）基本名詞flowcell： 測(cè)序反應(yīng)的載體/容器，1個(gè)flowcell有8個(gè)lanelane： 測(cè)序反應(yīng)的平行泳道附帽，試劑添加埠戳、洗脫等過(guò)程的發(fā)生位置tile： 每次熒光掃描的位...
-
用MrBayes構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹操作步驟整理總結(jié)
最近在學(xué)習(xí)構(gòu)建進(jìn)化樹，嘗試了用PHYML構(gòu)建ML樹和用MrBayes構(gòu)建貝葉斯樹蕉扮，因?yàn)闃?gòu)建ML樹時(shí)用的是網(wǎng)站的PHYML進(jìn)行的整胃，操作簡(jiǎn)便，所以就未做整理喳钟，只詳細(xì)整理了一下貝葉...
-
GATK：HaplotypeCaller變異檢測(cè)本文是閱讀一個(gè)做算法的文章屁使，有些收獲和想法，作為一種記錄我們?cè)谑褂胓atk call snp的時(shí)候奔则，常常使用HaplotypeCaller這個(gè)參數(shù)蛮寂，這個(gè)參數(shù)的目的是檢測(cè)出用來(lái)...
-
個(gè)人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問(wèn))
-
-
基因家族擴(kuò)張收縮分析- OrthoFinder聚類基因家族1. Summary 基因家族擴(kuò)張收縮分析可細(xì)分為六部分： 獲取每個(gè)基因?qū)?yīng)的最長(zhǎng)編碼區(qū)轉(zhuǎn)錄本 OrthoFinder聚類基因家族 系統(tǒng)發(fā)育樹推斷 物種分歧時(shí)間推斷 基因家族...
-
PAML-discussion-groupHi PAML Users,Welcome to the PAML discussion group. This site is for posting questions...
-
RNA-seq(5):序列比對(duì)：Hisat2比對(duì)軟件很多犁柜，首先大家去收集一下洲鸠，因?yàn)槲覀兪菐Т蠹胰腴T，請(qǐng)統(tǒng)一用hisat2(官網(wǎng)https://ccb.jhu.edu/software/hisat2/index.shtm...
-
小號(hào)請(qǐng)關(guān)注——生信教學(xué)網(wǎng)
-
maSigpro建模代碼分析之p.vector前言 上一次我們說(shuō)到了make.design.matrix瘾腰，maSigpro建模代碼分析之make.design.matrix[http://www.reibang.com...
