因?yàn)槭种杏袔浊l關(guān)鍵信息需要整理盏缤，所有的信息都規(guī)整的用txt保存蓖扑，但是我只需要其中有關(guān)鍵字后面的value值唉铜，怎么搞呢？幾千條信息手動(dòng)肯定是不可能的律杠，然后剛剛學(xué)習(xí)python...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：廣東
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python爬取關(guān)鍵字所在行并輸出到txt
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R語(yǔ)言-使用ggplot2繪制物種豐度堆疊柱狀圖本文使用某宏基因組測(cè)序數(shù)據(jù)中的種水平類群豐度表柜去，并直接根據(jù)所有種相對(duì)豐度總和灰嫉，提取出top10豐度的種類群，作圖展示這些種的豐度組成嗓奢，top10外的類群合并為“Others”...
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Window下如何下載SRA數(shù)據(jù)跑DADA2流程由于沒(méi)有服務(wù)器股耽，只能自己搗鼓著用windows的cmd命令行來(lái)批量下載一些數(shù)據(jù)根盒，但是windows下高通量測(cè)序數(shù)據(jù)（如sra）下載體驗(yàn)真的很差，沒(méi)辦法物蝙，只能硬著頭皮去搞 一、...
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學(xué)會(huì)正確選擇多序列比對(duì)（coding-sequences）軟件前幾天册赛，實(shí)驗(yàn)室的師弟師妹通過(guò)本地blast獲取一些沒(méi)有基因組注釋物種的蛋白編碼序列钠导。原本以為可以快速地進(jìn)行下一步的選擇壓力分析，沒(méi)想到卻在多序列比對(duì)這一環(huán)節(jié)出現(xiàn)了棘手的問(wèn)題辈双。...
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宏基因組分析概述
測(cè)序數(shù)據(jù)預(yù)處理——質(zhì)控：Trimmomatic 測(cè)序數(shù)據(jù)預(yù)處理——質(zhì)控統(tǒng)計(jì)：FastQC 序列組裝與基因預(yù)測(cè)——拼接：MEGAHIT 序列組裝與基因預(yù)測(cè)——ORF預(yù)測(cè)：Pro...
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PICRUSt2安裝及對(duì)16s數(shù)據(jù)進(jìn)行功能預(yù)測(cè)
1.PICRUSt簡(jiǎn)介 PICRUSt全稱為Phylogenetic Investigationof Communities by Reconstruction of Uno...
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云主機(jī)構(gòu)建生信服務(wù)器（一）——騰訊云的注冊(cè)及使用之前在自己的電腦上折騰過(guò)一段時(shí)間生物信息學(xué)，被各種軟件的安裝痰驱、數(shù)據(jù)的下載折騰到吐血证芭。雖然現(xiàn)在網(wǎng)上的教程很多，但總還是會(huì)卡在一些地方無(wú)法順利進(jìn)行下去担映。更不要說(shuō)一旦換了電腦所有的...
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只要肯用心，再簡(jiǎn)單的純生信論文都有機(jī)會(huì)發(fā)表
這次分享一下簡(jiǎn)單的生信數(shù)據(jù)挖掘發(fā)文思路，文章發(fā)表在Biomed Research International上粉私，該期刊的影響因子：2.276前酿，中科院分區(qū)：4區(qū)凶伙，參考范文出處：...
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使用vsearch,usearch和R語(yǔ)言進(jìn)行16s擴(kuò)增子分析以下教程中vsearch和usearch部分的操作在虛擬機(jī)中的ubuntu18系統(tǒng)下進(jìn)行。 1. 示例數(shù)據(jù)的下載 2. 雙端reads的合并 3. 引物剔除和數(shù)據(jù)質(zhì)控 4. ...
