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macbook pro 擴(kuò)容記我的 macbook 是 2015 年款的 13 retina 屏的 macbookpro脊凰；當(dāng)時選的容量是128G，也就是俗稱的乞丐版箭券；現(xiàn)在那個后悔啊净捅，嚴(yán)重不夠用啊。要知道蘋...
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MSKCC Research Associate<br>別趕不上野心滔以，又辜負(fù)了努力
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對群體遺傳學(xué)的基礎(chǔ)概念及相關(guān)分析，如系統(tǒng)發(fā)育研究坏匪，PCA（主成分分析）拟逮、群體結(jié)構(gòu)分析、親緣關(guān)系适滓、基因流等進(jìn)行介紹敦迄，旨在搭建一個群體遺傳學(xué)研究的學(xué)習(xí)平臺。
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苦逼的科研狗<br>記性不好所以一些東西就寫下來加深印象猛拴，正好分享給一些需要的朋友
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如何尋找同源基因---OrthoFinder
構(gòu)建物種的系統(tǒng)發(fā)育樹愉昆，計算kaks值或者比較基因組學(xué)和進(jìn)化的其他分析都少不了需要尋找同源基因职员。之前已經(jīng)介紹過Orthomcl的自動化使用，Orthomcl也是目前引用最好的尋...
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我很懶，但是我很可愛~~
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circos circlize ggbio gviz 等
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一些生物信息學(xué)用到的軟件，工具掌呜，介紹用法安裝以及以及應(yīng)用的文章 ?? 測序組裝使用的Spades滓玖、canu等等 ?? 序列比對比如blast、bowtie质蕉、diamond等 ?? 多序列比對比如mega势篡、clustalW、matff等 ?? 序列格式轉(zhuǎn)化的samtools模暗、bedtools等等 ?? 可變剪接分析的rMATS禁悠、MISO ?? 微衛(wèi)星序列查找工具misa等 ?? call peak的工具macs2 ?? 文獻(xiàn)下載工具Sci-hub桌面版 ?? 進(jìn)化樹構(gòu)建工具IQtree、ggtree等 ?? 同源基因查找工具OrthoMCL兑宇、OrthoFinder等 ?? 尋找測序中的結(jié)構(gòu)變異或者SNP序列GATK碍侦、bcftools等 ?? 宏基因組組裝與分析的anvi'o、QIMME ?? 測序質(zhì)量評估的FastQC隶糕、BUSCO祝钢、QUAST ?? 可視化工具比如IGV、3D Genome ?? 測序數(shù)據(jù)下載工具SRA Toolkit若厚、ascp等 ?? 數(shù)據(jù)可視化的工具circos 等等
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GO测秸，KEGG疤估，DO富集分析這是我聽B站鯪魚不會飛視頻（GO灾常，KEGG，DO富集分析）里的筆記哦~當(dāng)然有的地方加上的是我自己的理解铃拇，如果哪里和視頻上講的不一樣那是我自己發(fā)揮的钞瀑，自行忽略.... 市面上公...
