數(shù)據(jù)準(zhǔn)備GeneCount文件包含了所有同源基因組數(shù)目不為1的所有基因組堕花，在各個樣本中的數(shù)目筐摘；UnassignedGenes文件則包含了僅包含一個基因的同源基因組的樣本來源信...
發(fā)簡信
IP屬地：四川
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orthofinder分析泛基因組及可視化 -
基于Roary構(gòu)建泛基因組記錄安裝軟件 創(chuàng)建環(huán)境 運(yùn)行 NCBI下載{genome}.gbff格式的測試數(shù)據(jù) gbff轉(zhuǎn)gff格式 生成泛基因組 DeBUG !!!運(yùn)行中如果有關(guān)于Perl腳本的報(bào)錯孵延，例如...
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@路人里的路人 好的碳默，謝謝老師俊扭，他在orthofinder這一步就會給你推薦一個物種伐割，然后我把他作為外群就可以正常運(yùn)行了
使用orthofinder查找單拷貝基因并建樹
本文主要是對這篇文章利用orthofinder尋找單拷貝基因構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹 - 簡書 (jianshu.com)[http://www.reibang.com/p/52c2...
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老師忌穿，到第6步都照做了，第7步提示-o sepcific_species沒有用來作為外群的物種鞍燎选耕捞？
使用orthofinder查找單拷貝基因并建樹
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利用orthofinder尋找單拷貝基因構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹新的系列系列教程[http://www.reibang.com/p/10bb4410ae3d]已上傳，大家可以去看新的教程 1.orthofinder介紹 OrthoFin...
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生信小白一枚敞映，<br><br>有問題可以私信我较曼，<br><br>謝謝。
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看不懂了老師??構(gòu)建泛基因組這步用了哪些文件罢裨浮捷犹？（psvcp_v1.01-main/1Genome_construct_Pangenome.py；genome_gff_dir_example ;genome_list）這三個都是啥啊冕末。而且只用python命令就行了嘛萍歉？
泛基因組Psvcp測試
環(huán)境 測試 1構(gòu)建泛基因組 2 reads比對到泛基因組
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看迷糊了，先收藏了档桃，城购ⅲ看常新
DNA鏈方向上的小疑惑
雖然是做生物信息的，但是經(jīng)常被一些基礎(chǔ)性概念所困擾……而我又是一個強(qiáng)迫癥藻肄，于是把這些亂七八糟的東西整理了一下蔑舞，強(qiáng)行寫了一篇小文章。東西太雜嘹屯，但是彼此相關(guān)攻询，實(shí)在想不到什么合適的...
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DNA鏈方向上的小疑惑
雖然是做生物信息的，但是經(jīng)常被一些基礎(chǔ)性概念所困擾……而我又是一個強(qiáng)迫癥州弟，于是把這些亂七八糟的東西整理了一下钧栖，強(qiáng)行寫了一篇小文章低零。東西太雜，但是彼此相關(guān)拯杠，實(shí)在想不到什么合適的...
