1.準(zhǔn)備 TxDb 2.讀入peak文件 3.畫圖
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：湖北
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canu 組裝PacBio數(shù)據(jù)
基因組組裝的三個(gè)層次痰娱，contig, scaffold和chromosomes.contig表示從大規(guī)模測(cè)序得到的短讀(reads)中找到的一致性序列浪藻。組裝的第一步就是從短片...
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CHIP-seq（四）motif analysis
HOMER is a software for motif discovery and ChIP-Seq analysisHOMER軟件使用Perl和C++編寫饶套，可在UNIX...
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洛陽伊川小麥生長(zhǎng)情況調(diào)查2020-03-19現(xiàn)在洛陽小麥都進(jìn)入了拔節(jié)期祟峦，有一小部分品種過于早熟進(jìn)入了孕穗期窃页，個(gè)別的已經(jīng)抽穗。大部分品種都在拔節(jié)中期郑什。也有一些種的很晚的11月左右種的密剛剛拔節(jié)府喳，小穗分化剛剛完成。早熟品種...
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土壤水分特征參數(shù)估計(jì)（soil water characteristic）引言 土壤水分特征是水文學(xué)研究的重點(diǎn)蘑拯，在作物模型中也是計(jì)算土壤水平衡不可或缺的參數(shù)钝满。研究中一般用水分特征曲線來反映土壤的持水特征，滲透特征曲線可以反映土壤滲透特征申窘。這里面有幾...
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ChIP-seq（三）MACS2 peak calling
MACS2（Model-based Analysis of ChIP-seq）usage： -t：--treatment file弯蚜；-c：Control file；-f：--...
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ChIP-seq（二）Visualization可視化Visualization Convert bam to BigWig 1. bam to bedGraph：bedGraph存放區(qū)間的坐標(biāo)軸信息和相關(guān)評(píng)分的文件偶洋，一共...
