劉小澤寫于2020.6.27為何取名叫“交響樂”？因為單細胞分析就像一個大樂團，需要各個流程的協(xié)同配合單細胞交響樂1-常用的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)SingleCellExperiment單...
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單細胞交響樂4-歸一化 -
DNA甲基化測序數(shù)據(jù)處理（一）：數(shù)據(jù)比對前言 因為組里面出了一批甲基化測序數(shù)據(jù)安皱，使用的技術(shù)為BS-seq唯袄，處理的時候順帶記錄了學(xué)習(xí)過程飒赃，演示使用數(shù)據(jù)為官方提供的example.fastq冒嫡。 DNA甲基化及CpG島定...
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Dapars2 分析可變多聚腺苷酸化（APA 3’UTR）與腫瘤
越來越懶了艰亮，不想寫記錄呀！算了挣郭，強迫自己一把迄埃！ 水平有限，若有錯誤兑障，懇請指出调俘！ 信使RNA ( messenger RNA, mRNA)加工過程中的精細調(diào)控對基因的表達具有重...
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讀書寫作彩库，游山玩水，運動鍛煉先蒋，定制（旅游骇钦，旅行）線路
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中科院碩博生一枚俯邓，用簡書來記錄自己精讀paper和學(xué)習(xí)生信的過程。
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機器學(xué)習(xí)實戰(zhàn)之訓(xùn)練模型-多項式回歸（一）–泛化和學(xué)習(xí)曲線
本文介紹了多項式回歸的過擬合和欠擬合琴拧、泛化能力和學(xué)習(xí)曲線，通過對比測試集和驗證集的MSE的學(xué)習(xí)曲線嘱支，判斷擬合是過擬合還是欠擬合蚓胸，尋找到最合適的模型。 高階多項式回歸對訓(xùn)練數(shù)據(jù)...
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十分鐘掌握多項式回歸：擬合非線性關(guān)系
之前我們曾經(jīng)學(xué)習(xí)了簡單線性回歸模型的推導(dǎo)除师、sklearn實戰(zhàn)沛膳，并嘗試從零搭建了一個簡單線性回歸的模型工具。 但是我們遇到的數(shù)據(jù)并不總是線性的汛聚，這時如果我們還拿線性模型去擬合锹安，...
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可教學(xué)（轉(zhuǎn)錄組測序痕貌、單細胞測序
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MIT 公開課：Gilbert Strang《線性代數(shù)》課程筆記（線代學(xué)習(xí)資料備份）
MIT Open Course：Gilbert Strang Linear Algebra麻省理工公開課：Gilbert Strang 線性代數(shù)MIT 官方課程網(wǎng)站 網(wǎng)易公開...
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tSNE和UMAP的區(qū)別
這一篇是我的學(xué)習(xí)筆記风罩，先附上學(xué)習(xí)鏈接：https://mp.weixin.qq.com/s/qkbc1vz-ERHzGp8gfLiVsg 首先，這是兩種降維的scRNA-se...
