16SrRNA 基因通常作為分子標(biāo)記進(jìn)行微生物群落結(jié)構(gòu)的研究社裆，但是它有一些明顯的限制摆碉，比如16S rRNA基因在物種中會有多個拷貝捧杉，而且片拍，由于16S rRNA基因的進(jìn)化速率較...
發(fā)簡信
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Fungene分析流程比較以nifH為例 -
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您好歉糜，用figaro分析截斷位置所用的數(shù)據(jù)是未去除引物序列的宪卿，而dada2處理的是去除引物的的诵，這個截取位置會不會變化？
一文完不成qiime2微生物多樣性分析(2021版上)
之前寫過一系列qiim2的教程都是零零散散的記錄佑钾，里面也有不少命令打錯的步驟給各位小伙伴造成了不少的疑惑西疤，恰逢qiime2-2020.11發(fā)布，所以就在重新總結(jié)一次休溶，這次稍后...
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Enterotypes of the human gut microbiome德國海德爾堡發(fā)表在Nature上的第一篇腸型分析 對于人類腸道微生物的了解快速增長代赁，但是這些認(rèn)識仍是基于很少一部分的人群的，世界范圍上的差異并不清楚兽掰。從來自四個國家的22個分...
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NG | 孟德爾隨機分析菌群&代謝物因果關(guān)系文章標(biāo)題：Mendelian randomization analyses support causal relationships between blood metabo...
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2019-02-13批量將文件以文件夾名字命名
運用SPAdes拼接完細(xì)菌基因組候，拼接完的結(jié)果保存在OutFileName/contigs.fasta院溺，通常需要重命名然后下載到本地計算機進(jìn)一步分析楣嘁。在樣本多的情況下，批處...
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決定用四年的時間記錄自己的成長；<br>女孩子也可以努力的很漂亮谆膳；<br>喜歡的東西都很貴叭爱，所以要加油呀。<br>VX公共號：學(xué)生菌口替代表
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review-腸道菌群與不健康衰老：區(qū)分原因與后果summary 現(xiàn)狀： 1.腸道菌群會隨著年齡改變杨帽，但是這種變化是由于生理變化漓穿、免疫衰老、炎癥注盈、飲食晃危、藥物還是長期的健康情況引起的尚不明確 2.發(fā)現(xiàn)腸道菌群與長壽人群有密切關(guān)...
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教你畫一個掰彎的熱圖（Heatmap）汹想，展示更多的基因表達(dá)量難道外邓，這不像孔雀開屏嗎？ 寫在前面 組學(xué)數(shù)據(jù)已經(jīng)泛濫古掏，但是信息的挖掘仍任重道遠(yuǎn)损话。順手的工具，可以節(jié)省使用者盡可能多的時間槽唾，或者將看起來很復(fù)雜丧枪，很難以完成的事情，變得非常簡單庞萍。...
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收集一些生物信息學(xué)的分析流程的文章钝计。感謝這些簡友整理的生信分析流程恋博！ 如果簡友投稿沒有被我收入專題，可能是我沒看到或者收入到其他針對性更強的專題中了私恬。望見諒债沮！ ???????????????????????? 文章的收錄是有順序的，查看的時候請點擊“最新收錄”然后進(jìn)行查看本鸣。 ?? 全基因組測序(WGS)分析 ?? 轉(zhuǎn)錄組分析RNA-seq的分析流程 ?? 染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)ATAC-Seq疫衩、ChIP-Seq分析 ?? 單細(xì)胞scRNA-seq分析 ?? 癌癥的預(yù)后標(biāo)志物查找 ?? 系統(tǒng)發(fā)育演化進(jìn)化樹構(gòu)建與分析 ?? 群體遺傳學(xué)分析 ?? 全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS) ?? 基因家族的分析 ?? 甲基化測序與分析 ?? KEGG/GO功能富集分析 ?? 圖形繪制具體細(xì)節(jié)的比如熱圖、曼哈頓圖的繪制等 ?? python荣德、perl闷煤、R的包的使用過程 ?? 具體工具的使用，比如GATK的使用過程 ?? 數(shù)據(jù)庫的挖掘方法命爬，比如TCGA數(shù)據(jù)庫的使用 ?? 另外就是整個文章走下來的流程 ?? ?? ??
