歡迎關(guān)注”生信修煉手冊”! ChIPpeakAnno是一個bioconductor上的R包赶舆，針對peak calling之后的下游分析朴下，提供了以下多種功能 查找與peak區(qū)域...
發(fā)簡信
IP屬地：福建
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使用ChIPpeakAnno進行peak注釋
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ChIP-seq實踐（非轉(zhuǎn)錄因子戈咳，非組蛋白）在實戰(zhàn)之前，首先對CHIP-seq分析做一些了解，以下是從各個地方copy過來綜合起來的，有些散亂，是我認為重要以及應(yīng)該了解的知識點峡扩。chip-seq 實戰(zhàn)就跟在轉(zhuǎn)錄組和外顯...
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我的ChIP-Seq(4):MAnorm差異分析哈哈，搜了一圈沒發(fā)現(xiàn)網(wǎng)上有關(guān)于MAnorm的中文教程或者是說明障本，本文將是第一篇~撒花??ヽ(°▽°)ノ?那就要用心寫了教届，感到鴨梨.jpg== 首先，MAnorm是什么驾霜，可以做...
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制作U盤啟動盤案训，CentOS系統(tǒng)安裝筆者以前沒重裝過系統(tǒng)，大學太懶了寄悯，連windows系統(tǒng)也沒重裝過萤衰，公司要用CentOS7作為服務(wù)器，讓我拿一臺舊機重裝下Linux系統(tǒng)猜旬，今天寫下安裝步驟脆栋，如有坑和不足之處，還...
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ChIP-seq數(shù)據(jù)分析（一）：從raw reads到peaks開篇致謝：下面內(nèi)容的整個框架是跟著生信技能樹發(fā)布在bilibili上的ChIP-seq視頻學習的洒擦，鏈接：https://www.bilibili.com/video/av29...
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deepTools 的使用（一）官方參考 https://deeptools.readthedocs.io/en/develop/content/installation.html 下載安裝 python ...
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ChIP-seq分析的數(shù)據(jù)標準
以下羅列了ChIP-seq數(shù)據(jù)分析中的ENCODE標準椿争，針對不同的免疫共沉淀類型有不同的標準，以下從組蛋白和轉(zhuǎn)錄因子2個方向介紹： 一熟嫩、組蛋白 生物學重復： 至少2個 抗體：...
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【Bioconductor系列】如何用Bioconductor對基因組注釋
這一次秦踪，我們來聊聊基因組注釋。首先問自己一個問題，為什么要進行基因注釋椅邓。就我目前而言柠逞，它用來解決如下問題： 在mapping-by-sequencing的時候，我找到了一些可...
