CellChat 三部曲3:具有不同細(xì)胞類型成分的多個數(shù)據(jù)集的細(xì)胞通訊比較分析 加載所需的包[#load-the-required-libraries] 第一部分:比較分析具...
CellChat 三部曲3:具有不同細(xì)胞類型成分的多個數(shù)據(jù)集的細(xì)胞通訊比較分析 加載所需的包[#load-the-required-libraries] 第一部分:比較分析具...
CellChat三部曲1:使用CellChat對單個數(shù)據(jù)集進行細(xì)胞間通訊分析 自從周運來在簡書寫了一篇cellchat的中文介紹教程硝清,然后R包作者也在B站做了直播介紹系任,cel...
本文參考ggpubr包官方文檔https://rpkgs.datanovia.com/ggpubr/index.html[https://rpkgs.datanovia.co...
CellChat 三部曲2:使用CellChat 對多個數(shù)據(jù)集細(xì)胞通訊進行比較分析 加載所需的包[#load-the-required-libraries] 創(chuàng)建目錄以保存圖...
前言 在前面的一講內(nèi)容里(單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)進階分析—《細(xì)胞通訊》2.1CellChat基礎(chǔ)分析教程[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzAwMz...
事情是這樣的:前面我們發(fā)布了這樣一款函數(shù)((原創(chuàng)函數(shù))-Cellchat受配體多組比較氣泡圖函數(shù)[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg5OT...
0. 背景知識 細(xì)胞通訊是單細(xì)胞數(shù)據(jù)高級分析中比較常見的一個,我們習(xí)慣使用的R包是CellChat袋哼。 這個是CellChat的一手教程: https://htmlprevie...
圖是關(guān)于互作分析受配體的展示。橫軸是source cell浅悉,縱軸是受配體對闽颇,展示了每個source與其他細(xì)胞的互作,也展示了每個組之間結(jié)果雏掠。其實看圖就可以想到斩祭,用分面圖就ok...
我們之前介紹過一個函數(shù)(基于cellchat互作分析:弦圖展示細(xì)胞互作受配體對結(jié)果(一鍵函數(shù))[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg5OTY...